欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计32篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.ADARs在癌症中作为环状转录组的有效调控因子
标题：ADARs act as potent regulators of circular transcriptome in cancer
杂志：Nat Commun
影响因子：14.919
通讯作者：Leilei Chen（新加坡国立大学）
环状RNAs (circRNAs)是通过头尾反向剪接产生的，这主要是由内含子两侧环状RNAs的反向互补配对(RCMs)促进的。腺苷脱氨酶作用于RNA (ADARs)，已知的双链RNA结合腺苷和肌苷(A-to-I) RNA编辑。在本文中，作者通过识别超过1000个受ADARs双向调控的环状RNAs，并将其定义为环状转录组的有效调控因子。研究发现，编辑可以通过纠正A:C与I(G)-C配对的不匹配或创建I(G)来稳定或破坏RCM之间形成的二级结构。实验证据表明，编辑也有利于RNA结合蛋白(如PTBP1)的结合，以调节反向剪接。这些ADARs调控的环状RNAs在多种类型的癌症中普遍表达，表明与癌症具有高度的功能相关性。研究结果支持了迄今为止未被重视的ADARs对环状转录组的双向调控，并强调了RNA加工过程中串音的复杂性及其对肿瘤发生的贡献。
ADAR调控circRNAs编辑流程
2.iGRLCDA:基于图表示学习识别circRNA与疾病的关联
标题：iGRLCDA: identifying circRNA–disease association based on graph representation learning
杂志：Brief Bioinform
影响因子：11.622
通讯作者：Lun Hu（中国科学院新疆理化技术研究所），Zhu-Hong You和Lei Wang（广西科学院大数据与智能计算研究中心）
随着核糖核酸序列测序(RNA-seq)和转录本组装分析技术的不断改进，近十年来，一种新的RNA转录本拓扑结构被发现，称为环状RNA (circRNA)。近年来，研究人员发现它们与信使RNA (mRNA)和长非编码RNA相竞争，并与microRNA结合调控基因。因此，假设circRNA与复杂疾病相关，发现它们之间的关系将有助于医学研究。然而，在体外鉴定circRNA和疾病之间的关系需要很长时间，而且通常没有方向。这些年来，越来越多的关联被实验证实。为此，作者提出了一种基于图表示学习(iGRLCDA)的circRNA -疾病关联识别计算方法，利用图卷积网络(GCN)和图分解(GF)的深度学习模型预测circRNA与疾病的潜在关联。其中，iGRLCDA首先利用高斯交互轮廓(GIP)核结合疾病语义信息，推导出circRNA与疾病已知关联的隐藏特征，形成数字描述符。之后，进一步使用GCN和GF的深度学习模型从描述符中提取隐藏特征。最后，引入随机森林分类器来识别潜在的circRNA与疾病的关联。在金标准数据下，iGRLCDA的5倍交叉验证与其他优秀的预测模型相比具有较强的竞争力，获得了受试者工作特征曲线下的平均面积为0.9289，精确召回曲线下的平均面积为0.9377。回顾相关文献的预测结果，在最近发表的论文中，预测的前30个circRNA-疾病相关性中有22个被提到。这些特殊的结果证明该，iGRLCDA可以为医学研究提供可靠的circRNA -疾病关联，减少实验室实验的盲见度。
3. 氧化应激诱导的circKIF18A下调可损伤MCM7介导的椎间盘退变抗衰老
标题：Oxidative stress-induced circKIF18A downregulation impairs MCM7-mediated anti-senescence in intervertebral disc degeneration
杂志：Exp Mol Med
影响因子：8.718
通讯作者：沈舒滢研究员，范顺武主任医师，沈立峰副主任医师（浙江大学医学院附属邵逸夫医院骨科），王向阳主任医师（温州医科大学附属第二医院脊柱外科）
由椎间盘退变(IVDD)引起的下腰痛是世界范围内最常见的残疾和财政支出原因之一。然而，除了手术干预外，缺乏有效的药物治疗来预防IVDD的进展。本研究旨在探讨一种新型环状RNA circKIF18A对IVDD进展的影响，并探讨其在IVDD中的潜在机制。在本研究中，作者发现氧化应激与IVDD中的髓核细胞(nucleus pulposus cell, NPC)衰老呈正相关，circKIF18A在IVDD中下调，减弱了NPCs中的细胞周期阻滞和细胞外基质降解等衰老表型。在机制上，circKIF18A竞争性地抑制了泛素介导的MCM7的蛋白酶体降解，并且在氧化应激下，circKIF18A对NPCs的保护作用部分是由MCM7介导的。椎间盘内注射腺病毒circKIF18A可改善大鼠IVDD模型。本研究揭示了circKIF18A通过稳定MCM7调控鼻咽癌变性，并确定了一个新的信号通路，即circKIF18A-MCM7轴，用于IVDD的抗衰老分子治疗。
椎间盘退变的MRI分级核磁共振图像
文献列表
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
| 1 | ADARs在癌症中作为环状转录组的有效调控因子 | ADARs act as potent regulators of circular transcriptome in cancer | Nat Commun | 14.919 | 新加坡国立大学 |
| 2 | iGRLCDA:基于图表示学习识别circRNAs与疾病的关联 | iGRLCDA: identifying circRNA-disease association based on graph representation learning | Brief Bioinform | 11.622 | 罗彻斯特理工学院，枣庄学院，中国科学院大学 |
| 3 | 氧化应激诱导的circKIF18A下调可损伤MCM7介导的椎间盘退变抗衰老 | Oxidative stress-induced circKIF18A downregulation impairs MCM7-mediated anti-senescence in intervertebral disc degeneration | Exp Mol Med | 8.718 | 温州医科大学附属第二医院，浙江大学医学院 |
| 4 | CircTHBS1以ceRNA和RBP依赖的方式通过增加INHBA mRNA的表达和稳定性来驱动胃癌进展 | CircTHBS1 drives gastric cancer progression by increasing INHBA mRNA expression and stability in a ceRNA- and RBP-dependent manner | Cell Death Dis | 8.469 | 南京医科大学第一附属医院普外科 |
| 5 | 线粒体编码的环状RNAs在植物中广泛存在并可翻译 | Mitochondrion-encoded circular RNAs are widespread and translatable in plants | Plant Physiol | 8.34 | 华南农业大学，中国农业科学院深圳农业基因组研究所 |
| 6 | 环状RNAs作为乳腺癌潜在的生物标志物 | Circular RNAs as Potential Biomarkers in Breast Cancer | Biomedicines | 6.081 | 那不勒斯大学 |
| 7 | CircESRP1通过miR-874-3p/CPEB4轴增强子宫内膜癌的转移和上皮-间质转化 | CircESRP1 enhances metastasis and epithelial-mesenchymal transition in endometrial cancer via the miR-874-3p/CPEB4 axis | J Transl Med | 5.531 | 华中科技大学同济医学院附属协和医院妇产科 |
| 8 | 环状RNA分析鉴定了一种新型的circPPARA，可促进猪的肌内脂肪沉积 | Circular RNA Profiling Identifies Novel circPPARA that Promotes Intramuscular Fat Deposition in Pigs | J Agric Food Chem | 5.279 | 沈阳农业大学动物科技学院 |
| 9 | 下调circ_0055412可通过调节CAPG和Wnt/β-catenin信号通路促进胶质瘤细胞对顺铂的敏感性 | Knockdown of circ_0055412 promotes cisplatin sensitivity of glioma cells through modulation of CAPG and Wnt/β-catenin signaling pathway | CNS Neurosci Ther | 5.243 | 新疆医科大学第一附属医院 |
| 10 | 高剂量雄激素诱导细胞自噬死亡，通过改变circRNA-BCL2/miRNA-198/AMBRA1信号通路抑制enzalutamide耐药前列腺癌的生长 | High-dose-androgen-induced autophagic cell death to suppress the Enzalutamide-resistant prostate cancer growth via altering the circRNA-BCL2/miRNA-198/AMBRA1 signaling | Cell Death Discov | 5.241 | 安徽医科大学第二附属医院，罗彻斯特大学，中国医科大学附属医院 |
| 11 | CircRBM33下调可通过microRNA-542-3p/HIF-1α轴抑制缺氧诱导的糖酵解并促进乳腺癌细胞凋亡 | CircRBM33 downregulation inhibits hypoxia-induced glycolysis and promotes apoptosis of breast cancer cells via a microRNA-542-3p/HIF-1α axis | Cell Death Discov | 5.241 | 嘉兴市第二医院乳腺外科 |
| 12 | 荷斯坦奶牛泌乳早期和非泌乳期乳腺组织中环状RNAs的鉴定与特征 | Identification and Characterization of Circular RNAs in Mammary Tissue from Holstein Cows at Early Lactation and Non-Lactation | Biomolecules | 4.879 | 扬州大学，达尔富尔大学，加拿大圭尔夫大学 |
| 13 | Circ_0058063作为miR-335-5p的RNA海绵，通过上调B2M来促进膀胱癌细胞对顺铂的耐药 | Circ_0058063 contributes to cisplatin-resistance of bladder cancer cells by upregulating B2M through acting as RNA sponges for miR-335-5p | BMC Cancer | 4.43 | 中国医科大学 |
| 14 | 综合生物信息学分析鉴定具有潜在功能的环状RNA hsa_circ_0070934和hsa_circ_0004315为肝细胞癌的预后因素 | Identification of potentially functional circular RNAs hsa_circ_0070934 and hsa_circ_0004315 as prognostic factors of hepatocellular carcinoma by integrated bioinformatics analysis | Sci Rep | 4.379 | 伊朗医科大学医学院 |
| 15 | 全基因组环状RNA分析和内源性RNA调控网络分析为龙眼早期体细胞胚胎发生的分子机制提供了新的见解 | Genome-wide circular RNA profiling and competing endogenous RNA regulatory network analysis provide new insights into the molecular mechanisms underlying early somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour | Tree Physiol | 4.196 | 福建农林大学 |
| 16 | CircOAS3通过JNK/STAT3/NF-κB信号通路与Hsc70相互作用调控角质细胞增殖和银屑病炎症 | CircOAS3 Regulates Keratinocyte Proliferation and Psoriatic Inflammation by Interacting with Hsc70 via the JNK/STAT3/NF-κB Signaling Pathway | Inflammation | 4.092 | 山东大学齐鲁医院 |
| 17 | 口蹄疫病毒感染PK-15细胞后差异表达环状RNAs的分析及功能分析 | Profiling and functional analysis of differentially expressed circular RNAs identified in foot-and-mouth disease virus infected PK-15 cells | Vet Res | 3.683 | 中国农业科学院兰州兽医研究所 |
| 18 | Circ_RPPH1通过结合miR-627-5p/miR-663a诱导SDC1表达调控胶质瘤细胞恶性肿瘤 | Circ_RPPH1 regulates glioma cell malignancy by binding to miR-627-5p/miR-663a to induce SDC1 expression | Metab Brain Dis | 3.584 | 西安交通大学第一附属医院神经外科 |
| 19 | 环状RNAs在冠心病心肌血管生成调控中的作用 | The role of circRNAs in the regulation of myocardial angiogenesis in coronary heart disease | Microvasc Res | 3.514 | 广西医科大学第一附属医院心内科 |
| 20 | 非编码RNAs作为结直肠癌的新兴调控因子和生物标志物 | Non-coding RNAs as emerging regulators and biomarkers in colorectal cancer | Mol Cell Biochem | 3.396 | 印度理工学院生物技术系 |
| 21 | Circ_0001093通过靶向miR-579-3p/谷氨酰胺酶轴促进食管鳞状细胞癌的谷氨酰胺代谢和癌症进展 | Circ_0001093 promotes glutamine metabolism and cancer progression of esophageal squamous cell carcinoma by targeting miR-579-3p/glutaminase axis | J Bioenerg Biomembr | 2.945 | 台州学院台州中心医院 |
| 22 | circADAMTS6-miR-324-5p-PIK3R3 ceRNA通路的调控可能是il -1β诱导骨关节炎软骨细胞的一种新机制 | Regulation of circADAMTS6-miR-324-5p-PIK3R3 ceRNA pathway may be a novel mechanism of IL-1β-induced osteoarthritic chondrocytes | J Bone Miner Metab | 2.626 | 杭州市第一人民医院骨科，萧山中医院骨科 |
| 23 | CircRNA circ_0043533通过靶向miR-1179促进多囊卵巢综合征细胞生长 | CircRNA circ_0043533 facilitates cell growth in polycystic ovary syndrome by targeting miR-1179 | Reprod Biol | 2.376 | 浙江中医药大学附属杭州中医医院妇科 |
| 24 | Circ_0043947在骨关节炎病理中通过海绵吸波miR-671-5p上调RTN3表达，参与白介素1β诱导的软骨细胞损伤 | Circ_0043947 contributes to interleukin 1β-induced injury in chondrocytes by sponging miR-671-5p to up-regulate RTN3 expression in osteoarthritis pathology | J Orthop Surg Res | 2.359 | 萍乡市人民医院 |
| 25 | CircRNA hsa_circ_0018289通过miR-1294/ICMT轴在宫颈癌进展中发挥致癌作用 | CircRNA hsa_circ_0018289 exerts an oncogenic role in cervical cancer progression through miR-1294/ICMT axis | J Clin Lab Anal | 2.352 | 临沂市中心医院 |
| 26 | Hsa_circ_0007142通过miR-494-3p/LASP1轴参与食管鳞状细胞癌顺铂耐药 | Hsa_circ_0007142 contributes to cisplatin resistance in esophageal squamous cell carcinoma via miR-494-3p/LASP1 axis | J Clin Lab Anal | 2.352 | 中国科学技术大学第一附属医院 |
| 27 | hsa_circ_0086720在胃癌中的生物学和临床意义及其临床应用 | Biological and clinical implications of hsa_circ_0086720 in gastric cancer and its clinical application | J Clin Lab Anal | 2.352 | 宁波大学医学院 |
| 28 | SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV编码剪接独立起源的环状RNAs | SARS-CoV-2, SARS-CoV and MERS-CoV encode circular RNAs of spliceosome-independent origin | J Med Virol | 2.327 | 俄亥俄州立大学，罗格斯大学新泽西医学院， |
| 29 | CircFOXK2通过miR-485-5p/PD-L1轴增强非小细胞肺癌的肿瘤发生和免疫逃逸 | CircFOXK2 enhances tumorigenesis and immune evasion in non-small cell lung cancer by miR-485-5p/PD-L1 axis | Anticancer Drugs | 2.248 | 自贡市第一人民医院 |
| 30 | 右美托咪定通过调节circ_0003340/miR-198/HMGA2轴阻断食管癌的肿瘤发生 | Dexmedetomidine disrupts esophagus cancer tumorigenesis by modulating circ_0003340/miR-198/HMGA2 axis | Anticancer Drugs | 2.248 | 潍坊市人民医院 |
| 31 | Circ_0058063通过海绵吸光miR-330-3p/SDC4轴促进甲状腺癌的进展 | Circ_0058063 promotes progression of thyroid cancer by sponging miR-330-3p/SDC4 axis | Anticancer Drugs | 2.248 | 成都医学院附属第一医院 |
| 32 | Circ_0101802通过调控miR-665/DVL3信号通路促进结直肠癌进展 | Circ_0101802 Facilitates Colorectal Cancer Progression Depending on the Regulation of miR-665/DVL3 Signaling | Biochem Genet | 1.89 | 惠州市中心医院 |