欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计35篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1.带有非栓系逆转录酶和环状RNA模板的sPE

标题:A split prime editor with untethered reverse transcriptase and circular RNA template

杂志:Nat Biotechnol

影响因子:54.908

通讯作者:Erik J Sontheimer和Wen Xue(美国麻省大学)

Prime Editor(PEs)的交付和优化受到其庞大规模和复杂性的阻碍。尽管分裂版本的基因组编辑工具可以减少结构尺寸,但它们需要特殊的工程来连接结合域和催化域。在这里,作者报告了一种分裂PE(sPE),其中Cas9-nickase(nCas9)与逆转录酶(RT)保持不受抑制。sPE在安装精确编辑方面的效率与母系未剥离PE3类似,插入-删除(indel)副产品没有增加。通过流体动力注射将sPE输送至小鼠肝脏,以修饰β-连环蛋白,以与PE3类似的效率促进肿瘤形成。在I型酪氨酸血症小鼠模型中,用两种腺相关病毒(AAV)载体递送纠正了致病突变。类似地,初级编辑指导RNA(pegRNAs)可以拆分为单个指导RNA(sgRNA)和环形RNA RT模板,以增加灵活性和稳定性。与以前的SPE相比,SPE缺少内含子、蛋白质-蛋白质亲和模块和核酸酶敏感的pegRNA延伸,这增加了构建的复杂性,并可能降低效率。这种模块化系统将促进PEs的交付和优化。

PE和sPE的构成

 

2.n6 -甲基腺苷修饰的circMAP3K4编码的一种新肽,可阻止肝细胞癌的凋亡

标题:A novel peptide encoded by N6-methyladenosine modified circMAP3K4

prevents apoptosis in hepatocellular carcinoma

杂志:Mol Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:蔡木炎副主任医师和谢丹主任医师(华南肿瘤学国家重点实验室),张弩主任医师(中山大学附属第一医院)

背景:环状RNAs(CircRNAs)调节各种生物活性,并已被证明在肝细胞癌(HCC)进展中发挥关键作用。然而,在癌症中只发现了少数编码的环状RNAs,它们在HCC中的作用仍不清楚。本研究旨在鉴定编码环RNAs并探讨其在肝癌中的作用。

方法:从CIRCpedia数据库中选择CircMAP3K4。进行了一系列实验,以确定circMAP3K4的特征和编码能力。通过体内和体外实验来研究circMAP3K4及其蛋白产物circMAP3K4‑455aa在肝癌中的生物学功能和机制。

结果:发现circMAP3K4是一种在HCC中具有编码潜能的上调circRNA。IGF2BP1识别circMAP3K4 N6-甲基腺苷修饰,并促进其转化为circMAP3K4-455aa。在功能上,circMAP3K4‑455aa通过与AIF相互作用阻止顺铂诱导的肝癌细胞凋亡,从而保护AIF免受切割并减少其核分布。此外,circMAP3K4‑455aa通过ubiq‑uitin–蛋白酶体E3连接酶MIB1途径降解。临床上,高水平的circMAP3K4是HCC患者不良总生存率和不良无病生存率的独立预后因素。

结论:CircMAP3K4是肝癌中高表达的circRNA。在m6A修饰的驱动下,circMAP3K4编码circMAP3K4‑455aa,保护肝癌细胞免受顺铂暴露,并预测肝癌患者的预后较差。靶向circMAP3K4‑455aa可能为肝癌患者,尤其是化疗耐药患者提供一种新的治疗策略。

 

   图文摘要

 

3. circNCOR1异常的核输出是smad7介导的膀胱癌淋巴结转移的基础

标题:Aberrant Nuclear Export of circNCOR1 Underlies SMAD7-Mediated Lymph Node Metastasis of Bladder Cancer

杂志:Cancer Res

影响因子:12.701

通讯作者:林天歆主任医师(中山大学孙逸仙纪念医院)

含有内含子的环状RNAs(circRNAs)通常被隔离在细胞核中。细胞内稳态的失调可以驱动其核输出,这可能参与了癌症的转移。然而,circRNAs核输出的机制及其在膀胱癌(BCa)淋巴结转移中的作用尚不清楚。在这里,作者发现了内含子保留的circRNA, circNCOR1,它在淋巴结转移的BCa中显著下调,并与患者不良预后负相关。circNCOR1的过表达抑制了BCa在体外和体内的淋巴管生成和淋巴结转移。核circNCOR1通过增加非均质核核糖核蛋白L (hnRNPL)诱导的SMAD7启动子H3K9乙酰化,从而在表观遗传上促进SMAD7的转录,从而抑制TGFβ-SMAD信号通路。circNCOR1的核保留由DDX39B的SUMOylation调控,DDX39B是负责环状RNAs核质转运的重要调控因子。减少SUMO2与DDX39B的结合显著增加了核内circNCOR1的保留,从而抑制BCa淋巴结转移。相比之下,SUMOylated DDX39B激活了circNCOR1的核输出,削弱了circNCOR1对TGFβ-SMAD级联激活和BCa LN转移的抑制作用。在病人来源的异种移植(PDX)模型中,过表达circNCOR1和抑制TGFβ信号通路显著抑制肿瘤生长和淋巴结转移。本研究强调,sumoylation诱导的circNCOR1核输出是调节TGFβ-SMAD信号和BCa淋巴管生成的关键事件,因此支持circNCOR1作为一种新的治疗LN转移性BCa患者的药物。

  

BCa中circNCOR1参与TGFβ/SMAD信号通路机制图

 

 

文献列表

 

 

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 带有非栓系逆转录酶和环状RNA模板的分裂prime编辑器 A split prime editor with untethered reverse transcriptase and circular RNA template Nat Biotechnol 54.908 美国麻省大学
2 n6 -甲基腺苷修饰的circMAP3K4编码的一种新肽,可阻止肝细胞癌的凋亡 A novel peptide encoded by N6-methyladenosine modified circMAP3K4 prevents apoptosis in hepatocellular carcinoma Mol Cancer 27.401 中山大学
3 circNCOR1异常的核输出是smad7介导的膀胱癌淋巴结转移的基础 Aberrant Nuclear Export of circNCOR1 Underlies SMAD7-Mediated Lymph Node Metastasis of Bladder Cancer Cancer Res 12.701 中山大学孙逸仙纪念医院
4 Hsa_circRNA_0088036作为ceRNA通过海绵吸光miR-140-3p促进膀胱癌进展 Hsa_circRNA_0088036 acts as a ceRNA to promote bladder cancer progression by sponging miR-140-3p Cell Death Dis 8.469 中国医科大学附属盛京医院
5 外泌体circGSE1通过诱导调节性T细胞的扩张,促进肝细胞癌的免疫逃逸 Exosomal circGSE1 promotes immune escape of hepatocellular carcinoma by inducing the expansion of regulatory T cells Cancer Sci 6.716 福建医科大学附属协和医院介入放射科
6 Circular RNA_0006014通过海绵吸波miR-885-3p调控NTRK2和PIK3/AKT通路促进乳腺癌进展 Circular RNA_0006014 promotes breast cancer progression through sponging miR-885-3p to regulate NTRK2 and PIK3/AKT pathway Aging (Albany NY) 5.682 同济大学医学院附属上海第十人民医院乳腺甲状腺外科
7 Circ_0036412通过hedgehog信号通路影响肝细胞癌的增殖和细胞周期 Circ_0036412 affects the proliferation and cell cycle of hepatocellular carcinoma via hedgehog signaling pathway J Transl Med 5.531 桂林医学院附属医院
8 外泌体环状RNAs在恶性肿瘤诊断和治疗中的作用及临床应用 Roles and clinical application of exosomal circRNAs in the diagnosis and treatment of malignant tumors J Transl Med 5.531 宁波大学
9 环状RNA分析鉴定了一种新型的circPPARA,可促进猪的肌内脂肪沉积 Circular RNA Profiling Identifies Novel circPPARA that Promotes Intramuscular Fat Deposition in Pigs J Agric Food Chem 5.279 沈阳农业大学动物科技学院
10 circ_0004140通过circ_0004140/miR-1184/CCL22轴促进LUAD肿瘤进展和免疫抵抗 circ_0004140 promotes LUAD tumor progression and immune resistance through circ_0004140/miR-1184/CCL22 axis Cell Death Discov 5.241 华中科技大学同济医学院
11 工程环状mRNAs用于蜘蛛丝蛋白的生产 Engineering Circularized mRNAs for the Production of Spider Silk Proteins Appl Environ Microbiol 4.792 天津工业生物技术研究院,中国科学院系统微生物技术重点实验室
12 CircTCF25作为miR-206的海绵,通过Jak2/p-Stat3/CypB轴支持胶质瘤的增殖、迁移和侵袭 CircTCF25 serves as a sponge for miR-206 to support proliferation, migration, and invasion of glioma via the Jak2/p-Stat3/CypB axis Mol Carcinog 4.784 兰州大学第二医院
13 环状RNA circFARSA在具有膀胱癌表型的肿瘤细胞中吸收microRNA-330-5p The circular RNA circFARSA sponges microRNA-330-5p in tumor cells with bladder cancer phenotype BMC Cancer 4.43 上海交通大学医学院瑞金医院泌尿外科
14 环状rna潜在功能的鉴定和环状RNA – miRNA – mRNA调控网络在牙周炎中的预测:填补生物信息学和临床需求之间的空白 Identification of potentially functional circRNAs and prediction of circRNA-miRNA-mRNA regulatory network in periodontitis: Bridging the gap between bioinformatics and clinical needs J Periodontal Res 4.419 上海交通大学,北卡罗来纳大学
15 cirbe2q2促进牛肌肉干细胞的分化,是骨骼肌发育的潜在调控分子 CircUBE2Q2 promotes differentiation of cattle muscle stem cells and is a potential regulatory molecule of skeletal muscle development BMC Genomics 3.969 广西大学
16 Hsa_circ_0008344可能通过调控miR-638/SZRD1通路促进胶质瘤肿瘤进展和血管生成 Hsa_circ_0008344 Promotes Glioma Tumor Progression and Angiogenesis Presumably by Regulating miR-638/SZRD1 Pathway Neurotox Res 3.911 长沙市中心医院肿瘤内科
17 Circ_0020123通过调控miR-512-3p/CORO1C在非小细胞肺癌中发挥致癌作用 Circ_0020123 plays an oncogenic role in non-small cell lung cancer depending on the regulation of miR-512-3p/CORO1C Thorac Cancer 3.5 南华大学附属南华医院
18 Exosomal circDNER通过靶向miR-139-5p/ITGB8增强肺癌的紫杉醇耐药和致瘤性 Exosomal circDNER enhances paclitaxel resistance and tumorigenicity of lung cancer via targeting miR-139-5p/ITGB8 Thorac Cancer 3.5 苏州大学第一附属医院胸外科
19 Hsa_circ_0030042通过miR-514a-3p/FOXO1轴促进血管平滑肌细胞的增殖和迁移 Hsa_circ_0030042 Facilitates the Proliferation and Migration of Vascular Smooth Muscle Cells via the miR-514a-3p/FOXO1 Axis J Endovasc Ther 3.487 郑州大学第一附属医院
20 环状RNA circ_0061140通过microRNA-653/己糖激酶2 (HK2)轴加速肺腺癌缺氧诱导的糖酵解、迁移和侵袭 Circular RNA circ_0061140 accelerates hypoxia-induced glycolysis, migration, and invasion in lung adenocarcinoma through the microRNA-653/hexokinase 2 (HK2) axis Bioengineered 3.269 浙江大学医学院第二附属医院
21 Hsa_circ_0056686来源于癌症相关的成纤维细胞,通过抑制内质网应激促进子宫平滑肌瘤细胞增殖并抑制细胞凋亡 Hsa_circ_0056686, derived from cancer-associated fibroblasts, promotes cell proliferation and suppresses apoptosis in uterine leiomyoma through inhibiting endoplasmic reticulum stress PLoS One 3.24 驻马店中心医院检验科
22 高通量测序(circRNA-seq)对长三角白羊颈部皮肤组织环状rna的综合分析 Integrative analysis of circRNAs from Yangtze River Delta white goat neck skin tissue by high-throughput sequencing (circRNA-seq) Anim Genet 3.169 扬州大学
23 circRNA在类风湿性关节炎患者外周血单个核细胞中的表达谱 Expression profile of circRNA in peripheral blood mononuclear cells of patients with rheumatoid arthritis BMC Med Genomics 3.063 江西中医药大学附属医院
24 Circ_0005576通过mir -1305依赖调控PAIP1在宫颈癌中发挥致癌作用 Circ_0005576 Exerts an Oncogenic Role in Cervical Cancer via miR-1305-Dependent Regulation of PAIP1 Reprod Sci 3.06 中国医科大学附属肿瘤医院
25 Circ_0000442通过影响miR-1229-3p和上调ZBTB1在乳腺癌中作为肿瘤抑制因子 Circ_0000442 functions as a tumor repressor in breast cancer by impacting miR-1229-3p and upregulating ZBTB1 Mamm Genome 2.957 南昌大学第二附属医院肿瘤科
26 干扰Hsa_circRNA_0060640通过靶向miR-214-3p和I型胶原α 2链抑制TGF-β2诱导的人晶状体上皮细胞增殖、运动和EMT Interfering Hsa_circRNA_0060640 Suppresses TGF-β2-Induced Proliferation, Motility and EMT in Human Lens Epithelium Cells by Targeting miR-214-3p and Collagen Type I alpha2 Chain Curr Eye Res 2.424 长江大学医学院
27 Hsa_circ_0058129通过miR-873-5p/卵磷脂样1轴调控甲状腺乳头状癌的发展 Hsa_circ_0058129 regulates papillary thyroid cancer development via miR-873-5p/follistatin-like 1 axis J Clin Lab Anal 2.352 中国科学院大学肿瘤医院
28 环状RNA hsa_circ_0011298通过调控miR-486-3p/CRABP2轴增强非小细胞肺癌对紫杉醇的耐药性 Circular RNA hsa_circ_0011298 enhances Taxol resistance of non-small cell lung cancer by regulating miR-486-3p/CRABP2 axis J Clin Lab Anal 2.352 广州中医药大学附属东莞医院第二内科
29 Circ_0009035通过靶向miR-1305/CREBRF轴调控宫颈癌的进展 Circ_0009035 regulates the progression of cervical cancer by targeting miR-1305/CREBRF axis Anticancer Drugs 2.248 台州市中心医院(台州大学附属医院)妇产科
30 circ_0003928基因敲低可通过miR-506-3p/HDAC4通路改善糖尿病肾病中高糖诱导的人肾小管上皮细胞功能障碍 Knockdown of circ_0003928 ameliorates high glucose-induced dysfunction of human tubular epithelial cells through the miR-506-3p/HDAC4 pathway in diabetic nephropathy Eur J Med Res 2.175 山东枣庄市医院肾内科
31 环状RNA -线粒体tRNA翻译优化1的高表达有助于宫颈癌高危人乳头瘤病毒感染的诊断 High Expression of Circular RNA-Mitochondrial tRNA Translation Optimization 1 Assists the Diagnosis of High-Risk Human Papillomavirus Infection in Cervical Cancer J Low Genit Tract Dis 1.925 赣州市肿瘤医院
32 Circ-CEP128下调通过调控miR-432-5p/MCL1提高宫颈癌紫杉醇敏感性 Downregulation of Circ-CEP128 Enhances the Paclitaxel Sensitivity of Cervical Cancer Through Regulating miR-432-5p/MCL1 Biochem Genet 1.89 重庆市妇幼保健院妇产科
33 Circ_0007841基因敲低通过mir -532-5p依赖的方式下调NFIB表达,使顺铂对卵巢癌细胞具有敏感性 Circ_0007841 knockdown confers cisplatin sensitivity to ovarian cancer cells by down-regulation of NFIB expression in a miR-532-5p-dependent manner J Chemother 1.714 武汉第六医院药剂科
34 环状RNA circ_0001445通过调节ABCG1作为miR-208b-5p的海绵,减轻ox- ldl诱导的人主动脉内皮细胞的内皮损伤 Circular RNA circ_0001445 alleviates the ox-LDL-induced endothelial injury in human primary aortic endothelial cells through regulating ABCG1 via acting as a sponge of miR-208b-5p Gen Thorac Cardiovasc Surg 1.517 中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院心血管内科
35 has_circ_0001944上调与结直肠癌患者预后和癌症进展的关系 Association of has_circ_0001944 upregulations with prognosis and cancer progression in patients with colorectal cancer Discov Oncol Not Found 中国医科大学第四附属医院普外科

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