欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计28篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.在胰腺导管腺癌中,Circular RNA circ-MTHFD1L通过miR-615-3p/RPN6轴诱导HR修复以促进吉西他滨耐药
标题:Circular RNA circ-MTHFD1L induces HR repair to promote gemcitabine resistance via the miR-615-3p/RPN6 axis in pancreatic ductal adenocarcinoma
杂志:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:11.161
通讯作者:陈实副主任医师,田毅峰主任医师和黄龙主治医师(福建省立医院肝胆胰外科)
背景:胰腺癌耐药是导致胰腺癌患者治疗效果不佳的主要原因。探索化疗耐药相关基因一直是肿瘤学研究的难点和热点。大量研究表明,环状RNAs(circRNAs)在胰腺癌的发生发展中起着关键作用。然而,环状RNAs在胰腺导管腺癌(PDAC)化疗耐药过程中的调控作用尚不完全清楚。
方法:基于GEO数据库与本中心数据的交叉分析,作者发现了一个与化疗耐药相关的新分子hsa_circ_0078297 (circ-MTHFD1L)。利用QRT-PCR检测环状RNAs、miRNAs和mRNAs在人类PDAC组织及其匹配的正常组织中的表达。circ-MTHFD1L与miR-615-3p/RPN6信号轴的相互作用通过双荧光素酶报告基因检测、荧光原位杂交(FISH) RNA免疫沉淀(RIP)检测等一系列实验得到证实。
结果:Circ-MTHFD1L在PDAC组织和细胞中显著升高。在PDAC患者中,circ-MTHFD1L表达水平越高,预后越差。机制分析显示circ-MTHFD1L作为内源性miR-615-3p海绵上调RPN6的表达,从而促进DNA损伤修复,发挥其增强吉西他滨化疗耐药性的作用。更重要的是,作者还发现沉默circle-MTHFD1L联合奥拉帕尼可以增加胰腺癌对吉西他滨的敏感性。
结论:Circ-MTHFD1L通过miR-615-3p/RPN6信号轴维持PDAC吉西他滨耐药。Circ-MTHFD1L可能是有效治疗PDAC的分子标志物。
PDAC细胞中的circ-MTHFD1L/miR-615-3p/RPN6信号机制图
2.巨噬细胞中的CircACTR2通过激活巨噬细胞炎症和肾小管上皮细胞的上皮-间质转化促进肾纤维化
标题:CircACTR2 in macrophages promotes renal fibrosis by activating macrophage inflammation and epithelial-mesenchymal transition of renal tubular epithelial cells
杂志:Cell Mol Life Sci
影响因子:9.261
通讯作者:王国慧副研究员(中南大学湘雅三医院胃肠外科)
巨噬细胞和小管上皮细胞(TECs)之间的相互作用积极调控肾纤维化的进展。在本研究中,作者揭示了环状RNA ACTR2 (circACTR2)在调节巨噬细胞炎症、上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)和肾纤维化发展中的意义。结果显示,UUO(单侧输尿管梗阻)诱导的肾纤维化与炎症和EMT的增加、对侧肾脏肥大、circACTR2和NLRP3的上调以及miR-561的下调相关。CircACTR2充分而本质地促进了巨噬细胞NLRP3炎症小体的激活、焦亡和炎症,并通过旁分泌作用刺激了TECs的EMT和纤维化。在机制上,circACTR2海绵化miR-561并上调NLRP3表达水平,诱导IL-1β的分泌。在TECs中,IL-1β通过上调fasin -1诱导肾纤维化。在体内,敲低circACTR2或升高miR-561可有效缓解肾纤维化。综上所述,circACTR2通过海绵化miR-561激活NLRP3炎症小体,促进巨噬细胞炎症反应,刺激巨噬细胞诱导的EMT和TECs纤维化。因此,敲低circACTR2和过表达miR-561可能有利于肾纤维化的治疗。
circACTR2通过海绵机制参与炎症反应,并诱导肾脏纤维化
3. circFAM120B在食管鳞癌中通过miR-661/PPM1L轴和PKR/p38 MAPK/EMT通路发挥肿瘤抑制作用
标题:circFAM120B functions as a tumor suppressor in esophageal squamous cell carcinoma via the miR-661/PPM1L axis and the PKR/p38 MAPK/EMT pathway
杂志:Cell Death Dis
影响因子:8.469
通讯作者:王建明教授(南京医科大学公共卫生学院)
circRNA表达的广泛变化强调了它们对癌症的多种特征的重要贡献;但其在食管鳞癌中的作用及机制尚不明确。在这里,作者采用了一种三步走的方法,首先筛选ESCC中显著差异表达的环状RNAs,然后进行外部验证研究,然后进行功能分析。通过Sanger测序、RNase R酶切、放线菌素D处理、亚细胞定位分析和荧光原位杂交来评估环状RNAs的特性。使用在线工具预测目标转录本,并通过双荧光素酶、RNA免疫沉淀、qRT-PCR和western blot进行验证。生物素标记的RNA-protein pull-down、质谱和RNA免疫沉淀被用来鉴定与环状RNAs相互作用的蛋白。作者进行了功能获得和功能丧失实验,以揭示环状RNAs及其靶基因和结合蛋白在增殖、转移和侵袭中的作用。作者观察到circFAM120B (hsa_circ_0001666)在癌组织和患者血浆中经常下调,其表达水平与ESCC患者的总生存期有关。过表达circFAM120B可抑制ESCC的增殖、转移和侵袭,而沉默circFAM120B可增强恶性表型。在机制上,circFAM120B主要位于细胞质中,保证其对miR-661的海绵作用,以恢复肿瘤抑制因子PPM1L的表达。作者观察到,circFAM120B可以通过促进RNA依赖性蛋白激酶(PKR)的泛素依赖性降解,进而调控p38 MAPK信号通路,降低其稳定性,从而抑制ESCC细胞中的EMTs。研究结果表明,circFAM120B是一种很有前途的ESCC生物标志物,它通过circFAM120B/miR-661/PPM1L轴和PKR/p38 MAPK/EMT通路发挥肿瘤抑制作用,支持其作为候选治疗靶点的重要性。
circFAM120B参与ESCC,发挥肿瘤抑制作用的机制
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 在胰腺导管腺癌中,Circular RNA circ-MTHFD1L通过miR-615-3p/RPN6轴诱导HR修复以促进吉西他滨耐药 | Circular RNA circ-MTHFD1L induces HR repair to promote gemcitabine resistance via the miR-615-3p/RPN6 axis in pancreatic ductal adenocarcinoma | J Exp Clin Cancer Res | 11.161 | 福建医科大学 |
2 | 巨噬细胞中的CircACTR2通过激活巨噬细胞炎症和肾小管上皮细胞的上皮-间质转化促进肾纤维化 | CircACTR2 in macrophages promotes renal fibrosis by activating macrophage inflammation and epithelial-mesenchymal transition of renal tubular epithelial cells | Cell Mol Life Sci | 9.261 | 中南大学湘雅三医院胃肠外科 |
3 | circFAM120B在食管鳞癌中通过miR-661/PPM1L轴和PKR/p38 MAPK/EMT通路发挥肿瘤抑制作用 | circFAM120B functions as a tumor suppressor in esophageal squamous cell carcinoma via the miR-661/PPM1L axis and the PKR/p38 MAPK/EMT pathway | Cell Death Dis | 8.469 | 南京医科大学 |
4 | 非编码RNAs在肝细胞癌代谢重编程调控中的作用及机制 | The role and mechanism of noncoding RNAs in regulation of metabolic reprogramming in hepatocellular carcinoma | Int J Cancer | 7.396 | 四川大学华西医院肝脏外科与肝移植科 |
5 | PltDB:用于疾病调查的基于血小板的基因表达数据库 | PltDB: a blood platelets-based gene expression database for disease investigation | Bioinformatics | 6.937 | 华中科技大学同济医学院协和医院 |
6 | 调节上皮-间充质转化的非编码RNAs:肝病的研究进展 | Non-coding RNAs regulating epithelial-mesenchymal transition: Research progress in liver disease | Biomed Pharmacother | 6.529 | 南京中医药大学附属张家港中医院 |
7 | miR-195-5p在人类实体癌中的作用和机制 | Roles and mechanisms of miR-195-5p in human solid cancers | Biomed Pharmacother | 6.529 | 南京医科大学第一附属医院普外科 |
8 | 非编码RNAs及其在紫杉醇化疗中的治疗:起始、进展和药物敏感性的机制 | Noncoding RNAs and their therapeutics in paclitaxel chemotherapy: Mechanisms of initiation, progression, and drug sensitivity | J Cell Physiol | 6.384 | 伊斯兰阿扎德大学,伊朗内沙布尔医科大学 |
9 | 急性淋巴细胞白血病中的线性和环状长非编码RNAs:从发病到分类和治疗 | Linear and Circular Long Non-Coding RNAs in Acute Lymphoblastic Leukemia: From Pathogenesis to Classification and Treatment | Int J Mol Sci | 5.923 | 浙江大学医学院 |
10 | 在骨关节炎中,环状RNA circ_0000423通过circ_0000423/miRNA-27b-3p/MMP-13轴调控软骨ECM合成 | Circular RNA circ_0000423 regulates cartilage ECM synthesis via circ_0000423/miRNA-27b-3p/MMP-13 axis in osteoarthritis | Aging (Albany NY) | 5.682 | 广州中医药大学,中山大学 |
11 | circHECTD1可减弱急性肺损伤肺泡上皮细胞的凋亡 | circHECTD1 attenuates apoptosis of alveolar epithelial cells in acute lung injury | Lab Invest | 5.662 | 郑州大学第一附属医院重症医学科 |
12 | 在妊娠期糖尿病期间,circMAP3K4通过调节miR-6795-5p/PTPN1轴调控滋养细胞的胰岛素抵抗 | circMAP3K4 regulates insulin resistance in trophoblast cells during gestational diabetes mellitus by modulating the miR-6795-5p/PTPN1 axis | J Transl Med | 5.531 | 中国医科大学附属盛京医院内分泌科 |
13 | 环状RNA circNIPBL通过基底部切除修复途径促进支气管上皮细胞nnk诱导的DNA损伤 | Circular RNA circNIPBL promotes NNK-induced DNA damage in bronchial epithelial cells via the base excision repair pathway | Arch Toxicol | 5.153 | 广州医科大学 |
14 | 法舒地尔治疗APPswe/PSEN1dE9转基因(APP/PS1)小鼠阿尔茨海默病的转录组分析 | Transcriptome analysis of fasudil treatment in the APPswe/PSEN1dE9 transgenic (APP/PS1) mice model of Alzheimer’s disease | Sci Rep | 4.379 | 山西大同大学医学院,山西中医药大学 |
15 | 乳腺癌来源的外泌体通过circHIPK3/miR-124-3p/MTDH轴促进微环境中内皮细胞的血管生成 | Breast cancer derived exosomes promoted angiogenesis of endothelial cells in microenvironment via circHIPK3/miR-124-3p/MTDH axis | Cell Signal | 4.315 | 华中科技大学同济医学院武汉中心医院甲状腺乳腺外科 |
16 | 苹果环状RNA在根、韧皮部、叶、花和果实中的表达特征 | Expression Characteristics in Roots, Phloem, Leaves, Flowers and Fruits of Apple circRNA | Genes (Basel) | 4.096 | 中国农业科学院农业农村部果树研究所 |
17 | 远端缺血后适应过程中CircRNA和miRNA的表达谱可减轻脑缺血/再灌注损伤 | CircRNA and miRNA expression profiles during remote ischemic postconditioning attenuate brain ischemia/reperfusion injury | Brain Res Bull | 4.077 | 云南省第一人民医院普外科二科,昆明医科大学 |
18 | Circ_100395在甲状腺乳头状癌中阻碍恶性肿瘤和糖酵解:涉及PI3K/AKT/mTOR信号通路 | Circ_100395 impedes malignancy and glycolysis in papillary thyroid cancer: involvement of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway | Immunol Lett | 3.685 | 武汉大学附属中南医院甲状腺乳腺外科 |
19 | 环状RNA:精神分裂症病理生理学中一种新的潜在调节因子 | Circular RNA: A novel and potential regulator in pathophysiology of schizophrenia | Metab Brain Dis | 3.584 | 鲁尔克拉国立理工学院生命科学系 |
20 | 下调circATXN7通过释放miR-7-5p抑制非小细胞肺癌的生长 | Downregulation of circATXN7 represses non-small cell lung cancer growth by releasing miR-7-5p | Thorac Cancer | 3.500 | 山西省肿瘤医院,中国医学科学院肿瘤医院附属山西医院,山西医科大学附属肿瘤医院 |
21 | circ_0004788/miR-515-5p/FGF2网络在鼻咽癌发展中的调控作用的确定 | Identification of the regulatory role of the circ_0004788/miR-515-5p/FGF2 network in nasopharyngeal carcinoma development | Head Neck | 3.147 | 徐州医科大学附属淮安医院放射肿瘤科 |
22 | 环RNA circTLK1通过靶向miR-26a-5p/DAPK1调控帕金森病中多巴胺能神经元损伤 | Circular RNA circTLK1 regulates dopaminergic neuron injury during Parkinson’s disease by targeting miR-26a-5p/DAPK1 | Neurosci Lett | 3.046 | 同济大学医学院附属东方医院放射科 |
23 | CircCDC6通过调控miR-3187-3p及其下游PRKAA2抑制结直肠癌肿瘤生长和糖酵解能量代谢 | CircCDC6 restrains tumor growth and glycolysis energy metabolism in colorectal cancer via regulating miR-3187-3p and downstream PRKAA2 | J Bioenerg Biomembr | 2.945 | 武汉市第一医院胃肠外科 |
24 | Circ_0075804通过靶向miR-1287-5p调控LASP1的表达,从而影响视网膜母细胞瘤的生物学过程 | Circ_0075804 Regulates the Expression of LASP1 by Targeting miR-1287-5p and Thus Affects the Biological Process of Retinoblastoma | Curr Eye Res | 2.424 | 山东省枣庄市医院眼科 |
25 | 外泌体环状RNA hsa_circ_0006220、hsa_circ_0001666作为诊断胰腺癌的生物标志物 | Exosomal circular RNA hsa_circ_0006220, and hsa_circ_0001666 as biomarkers in the diagnosis of pancreatic cancer | J Clin Lab Anal | 2.352 | 宁波大学医学院附属医院放射科 |
26 | hsa_circ_0000285通过调控miR-127-5p/CDH2促进甲状腺癌进展 | hsa_circ_0000285 facilitates thyroid cancer progression by regulating miR-127-5p/CDH2 | J Clin Lab Anal | 2.352 | 四川省人民医院,中国科学院四川转化医学研究医院 |
27 | Circ_0030998通过介导miR-1323/PDCD4轴抑制非小细胞肺癌顺铂耐药 | Circ_0030998 Restrains Cisplatin Resistance Through Mediating miR-1323/PDCD4 Axis in Non-small Cell Lung Cancer | Biochem Genet | 1.890 | 中国科学院电子科技大学四川省人民医院 |
28 | Circ_0088036通过miR-1263/ rel -活化的NF-κB通路介导类风湿关节炎成纤维细胞样滑膜细胞的进展和炎症 | Circ_0088036 mediated progression and inflammation in fibroblast-like synoviocytes of rheumatoid arthritis by miR-1263/REL-activated NF-κB pathway | Transpl Immunol | 1.708 | 兰州大学第二医院风湿免疫科 |