欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计33篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1.circRNA/Wnt轴在癌症中的功能作用

标题:The functional roles of the circRNA/Wnt axis in cancer

杂志:Molecular Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:李兰娟院士和Lu Juan(浙江大学医学院附属第一医院)

环状RNAs是共价闭合的非编码RNAs,在从病毒到植物到哺乳动物的广泛物种中广泛表达。环状RNAs在Wnt通路中富集。异常的Wnt通路激活参与了各种类型癌症的发生发展。越来越多的证据表明,circRNA/Wnt轴调节癌症相关基因的表达,进而调控癌症的进展。Wnt通路相关circRNA表达与许多临床特征明显相关。circRNA可以通过与Wnt通路相互作用来调节细胞的生物学功能。此外,Wnt通路相关的环状RNAs在癌症诊断、预后评估和治疗方面是很有前途的潜在生物标志物。本文就Wnt通路相关环状RNAs在肿瘤发生发展中的作用及临床应用的研究进展进行综述。

Wnt信号通路的分类

 

2.m6a介导的circMDK上调促进了肿瘤的发生,并作为肝细胞癌的纳米治疗靶点

标题:M6A-mediated upregulation of circMDK promotes tumorigenesis and acts as a nanotherapeutic target in hepatocellular carcinoma

杂志:Molecular Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:夏赞贤教授(中南大学生命科学学院)

背景:新证据表明环状RNAs(CircRNAs)在疾病发展中起着关键作用,尤其是在各种癌症中。然而,CircRNA在肝细胞癌(HCC)中的致癌性作用仍不清楚。

 

方法:进行RNA测序以确定成对HCC组织和非肿瘤组织中显著上调的CircRNA。CCK-8分析、集落形成、transwell和异种移植小鼠模型用于研究CircRNA在肝癌增殖和转移中的作用。用小干扰RNA(siRNA)沉默基因表达。RNA免疫沉淀、生物素下拉、RNA下拉、荧光素酶报告分析和western blot用于探索潜在的分子机制。

 

结果:来源于MDK基因第5外显子(命名为circMDK)的Hsa_circ_0095868被鉴定为一种新的致癌circRNA,在HCC中显著上调。circMDK的上调与N6甲基腺苷(m6A)的修饰和肝癌患者的低生存率有关。在机制上,circMDK吸收miR-346和miR-874-3p上调ATG16L1(自噬相关的16-Like 1),从而激活PI3K/AKT/mTOR信号通路,促进细胞增殖、迁移和侵袭。合成了聚(β-氨基酯)(PAEs)来辅助circMDK-siRNA(PAE-siRNA)的递送,在包括皮下、转移、原位和患者源性异种移植(PDX)模型在内的四种肝脏肿瘤模型中,该siRNA有效地抑制了肿瘤的进展,且没有明显的副作用。

 

结论:CircMDK可作为一种潜在的肿瘤生物标志物,通过miR-346/874-3p-ATG16L1轴促进HCC的进展。基于PAE的siRNA递送提高了靶向circMDK的siRNA的稳定性和效率。PAE-siRNA纳米粒在体内有效抑制肝癌的增殖和转移。为肝癌的治疗提供了一种有前途的纳米治疗策略。

图文摘要

 

3.环状RNA circHMGB2通过miR-181a-5p/CARM1轴驱动肺腺癌和鳞状细胞癌的免疫抑制和抗PD-1耐药性

标题:The circular RNA circHMGB2 drives immunosuppression and anti-PD-1 resistance in lung adenocarcinomas and squamous cell carcinomas via the miR-181a-5p/CARM1 axis

杂志:Molecular Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:吴永兵主任医师(南昌大学第二附属医院心脏大血管外科)

背景:之前的研究已经证实HMGB2在各种癌症中的致癌作用,但HMGB2衍生的CircRNA的生物学功能仍然未知。因此,本研究探究了HMGB2衍生的CircRNA在肺腺癌(LUAD)和鳞状细胞癌(LUSC)中的潜在作用。

 

方法:使用qRT–PCR评估HMGB2衍生的CircRNA在LUAD和LUSC组织以及匹配的正常组织中的表达谱。在体外,通过Transwell、CCK-8、流式细胞术和免疫组织化学分析,以及在免疫小鼠模型和人源化小鼠模型中,确定circHMGB2在LUAD和LUSC进展中的作用。此外,还进行了体内circRNA沉淀试验、荧光素酶报告试验和RNA下拉试验,以探索circHMGB2促进LUAD和LUSC抗PD-1耐药性的潜在机制。

 

结果:circHMGB2(hsa_circ_0071452)在NSCLC组织中的表达显著上调,生存分析表明circHMGB2是LUAD和LUSC患者预后不良的独立指标。研究发现circHMGB2对LUAD和LUSC细胞的增殖有轻微影响,但在免疫活性小鼠模型和人源化小鼠模型中,circHMGB2通过促进抗肿瘤免疫的耗尽,显著重塑了肿瘤微环境。从机制上讲,circHMGB2通过吸附miR-181a-5p来缓解下游CARM1的抑制,从而使LUAD和LUSC中的1型干扰素反应失活。此外,发现circHMGB2表达的上调降低了抗PD-1治疗的疗效,CARM1抑制剂EZM2302和抗PD-1抗体的组合在临床前模型中发挥了良好的协同效应。

 

结论:circHMGB2的过度表达主要通过重塑LUAD和LUSC患者的肿瘤微环境和调节抗PD-1耐药性来促进LUAD和LUSC的进展。本研究为LUAD和LUSC治疗提供了一种新策略。

circHMGB2通过海绵机制参与肿瘤免疫和PD-1耐药

 

4.序列元件对线性和环状RNAs亚细胞定位的上下文特异性影响

标题:Context-specific effects of sequence elements on subcellular localization of linear and circular RNAs

杂志:Nat Commun

影响因子:14.919

通讯作者:Igor Ulitsky(以色列魏兹曼科学院生物调控与分子神经科学系)

长RNA在转录后的命运变化很大,这种变化部分归因于短序列元件。使用大量平行RNA分析来研究来自非编码RNA的序列如何影响环状和线性RNA的亚细胞定位和稳定性,包括剪接和未剪接形式。结果发现,序列元素的作用强烈依赖于宿主RNA上下文,驱动线性和环状RNA核富集的序列之间重叠有限。特异性RNA结合蛋白的结合支持了其中一些差异——srsf1结合导致环状RNA的核富集;SAFB结合与主要不剪接的线性RNA的核富集有关;IGF2BP1促进线性剪接RNA分子的输出。因此,长RNA转录后的命运取决于特定序列元件的组合贡献、剪接以及线性RNA特有的末端特征的存在。

基因干扰后的文库构建

 

 

文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 circRNA/Wnt轴在癌症中的功能作用 The functional roles of the circRNA/Wnt axis in cancer Mol Cancer 27.401 浙江大学医学院第一附属医院
2 m6a介导的circMDK上调促进了肿瘤的发生,并作为肝细胞癌的纳米治疗靶点 M6A-mediated upregulation of circMDK promotes tumorigenesis and acts as a nanotherapeutic target in hepatocellular carcinoma Mol Cancer 27.401 中南大学生命科学学院
3 在肺腺癌和鳞状细胞癌中,环状RNA circHMGB2通过miR-181a-5p/CARM1轴驱动免疫抑制和抗pd -1耐药性 The circular RNA circHMGB2 drives immunosuppression and anti-PD-1 resistance in lung adenocarcinomas and squamous cell carcinomas via the miR-181a-5p/CARM1 axis Mol Cancer 27.401 南昌大学第二附属医院心胸外科
4 序列元件对线性和环状RNAs亚细胞定位的上下文特异性影响 Context-specific effects of sequence elements on subcellular localization of linear and circular RNAs Nat Commun 14.919 以色列魏兹曼科学院生物调控与分子神经科学系
5 EIF4A3诱导的circTOLLIP通过miR-516a-5p/PBX3/EMT通路促进肝细胞癌的进展 EIF4A3-induced circTOLLIP promotes the progression of hepatocellular carcinoma via the miR-516a-5p/PBX3/EMT pathway J Exp Clin Cancer Res 11.161 华中科技大学同济医学院同济医院
6 EIF4A3调控的circ_0087429可以通过mirR-5003-3p依赖的OGN表达上调逆转EMT,抑制宫颈癌的进展 EIF4A3-regulated circ_0087429 can reverse EMT and inhibit the progression of cervical cancer via miR-5003-3p-dependent upregulation of OGN expression J Exp Clin Cancer Res 11.161 同济大学医学院
7 circHIPK3对miR-30c/DLL4轴的失调对KSHV溶解复制至关重要 Dysregulation of the miR-30c/DLL4 axis by circHIPK3 is essential for KSHV lytic replication EMBO Rep 8.807 英国利兹大学,南非罗德大学
8 在肾细胞癌中,环状RNA circVAMP3通过调节LDHA促进有氧糖酵解和增殖 Circular RNA circVAMP3 promotes aerobic glycolysis and proliferation by regulating LDHA in renal cell carcinoma Cell Death Dis 8.469 中山大学孙逸仙纪念医院,中山大学附属第七医院
9 登革热发病机制中的宿主和病毒非编码RNAs Host and viral non-coding RNAs in dengue pathogenesis Rev Med Virol 6.989 印度博帕尔科学教育和研究所生物科学系
10 外泌体环状RNAs在实体癌和恶性血液病中的研究进展 The emerging landscape of exosomal CircRNAs in solid cancers and hematological malignancies Biomark Res 6.148 浙江大学医学院附属第一医院,江苏大学附属人民医院
11 ncRNAs介导的TIMM8A高表达与预后不良相关,并作为乳腺癌的致癌基因 ncRNAs-mediated high expression of TIMM8A correlates with poor prognosis and act as an oncogene in breast cancer Cancer Cell Int 5.722 南京医科大学第一附属医院,苏州大学附属第一医院
12 在狼疮性肾炎中,CircRTN4通过激活miR-513a-5p/FN轴加重系膜细胞功能障碍 CircRTN4 aggravates mesangial cell dysfunction by activating the miR-513a-5p/FN axis in lupus nephritis Lab Invest 5.662 河北医科大学
13 全转录组测序识别与原因不明的复发性妊娠流产相关的关键mRNAs、miRNAs、lncRNAs和环状RNAs Whole-transcriptome sequencing identifies key mRNAs, miRNAs, lncRNAs, and circRNAs associated with unexplained recurrent pregnancy loss Cell Tissue Res 5.249 南京医科大学附属妇产医院
14 circDHTKD1通过上调CXCL5促进膀胱癌的淋巴转移 circDHTKD1 promotes lymphatic metastasis of bladder cancer by upregulating CXCL5 Cell Death Discov 5.241 南京大学医学院附属鼓楼医院
15 Circ_0000811可作为miR-15b海绵,抑制prkar2a介导的JAK2/STAT1通路,减轻脑缺血眩晕 Circ_0000811 acts as a miR-15b sponge and inhibits Prkar2a-mediated JAK2/STAT1 pathway to attenuate cerebral ischemic vertigo Cell Death Discov 5.241 中国医科大学附属盛京医院神经内科
16 多个茎环引物诱导级联环介导等温扩增直接识别和特异性检测环状RNAs Multiple stem-loop primers induced cascaded loop-mediated isothermal amplification for direct recognition and specific detection of circular RNAs Analyst 4.616 北京科技大学材料科学与工程学院
17 从比较研究起源于哺乳动物ATXN2L内含子的环状RNA到理解内含子环状rna的起源 From the comparative study of a circRNA originating from an mammalian ATXN2L intron to understanding the genesis of intron lariat-derived circRNAs Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech 4.490 罗斯托克大学农业与环境科学学院
18 CircRNA CDR1as通过激活hippo信号通路促进糖尿病心肌病心肌细胞凋亡 CircRNA CDR1as promotes cardiomyocyte apoptosis through activating hippo signaling pathway in diabetic cardiomyopathy Eur J Pharmacol 4.432 哈尔滨医科大学药学院
19 与麻风分枝杆菌感染相关的骨细胞样细胞环状RNA – miRNA – mRNA网络的综合分析 A comprehensive analysis of the circRNA-miRNA-mRNA network in osteocyte-like cell associated with Mycobacterium leprae infection PLoS Negl Trop Dis 4.411 中南大学湘雅二医院
20 利用定量PCR技术对血液中mRNAs降解动力学及microRNAs、circRNAs、lncRNAs半衰期的影响因素进行了研究 Factors influencing degradation kinetics of mRNAs and half-lives of microRNAs, circRNAs, lncRNAs in blood in vitro using quantitative PCR Sci Rep 4.379 大连医科大学医学检验学院
21 结合circRNA、miRNA和mRNA分析揭示ceRNA在从胚胎到孵化后鸡肌肉发育中的调控作用 Integrative analysis of circRNA, miRNA, and mRNA profiles to reveal ceRNA regulation in chicken muscle development from the embryonic to post-hatching periods BMC Genomics 3.969 山东省农业科学院家禽研究所
22 转录因子ZEB1通过促进CircANKRD17的转录而介导上皮性卵巢癌的进展 The transcription factor ZEB1 mediates the progression of epithelial ovarian cancer by promoting the transcription of CircANKRD17 J Biochem Mol Toxicol 3.642 锦州医科大学附属第一医院妇产科
23 Circ_0005231通过海绵化miR-383-5p和调控KIAA0101促进食管鳞癌的进展 Circ_0005231 promotes the progression of esophageal squamous cell carcinoma via sponging miR-383-5p and regulating KIAA0101 Thorac Cancer 3.500 河北医科大学第四医院胸外科
24 基于高通量测序的糖尿病circRNA-mRNA表达谱和功能富集分析 Analysis of circRNA-mRNA expression profiles and functional enrichment in diabetes mellitus based on high throughput sequencing Int Wound J 3.315 北京大学国际医院神经外科
25 通过图注意自动编码器预测环状RNA -药物敏感性关联 Predicting circRNA-drug sensitivity associations via graph attention auto-encoder BMC Bioinformatics 3.169 河南城建学院计算机与数据科学学院
26 CircMiMi:构建环RNA-microRNA-mRNA跨物种相互作用的独立软件 CircMiMi: a stand-alone software for constructing circular RNA-microRNA-mRNA interactions across species BMC Bioinformatics 3.169 台湾中央研究院基因组学研究中心
27 CircRNA circ-ATAD1抑制miR-618成熟参与结直肠癌 CircRNA circ-ATAD1 suppresses miR-618 maturation to participate in colorectal cancer BMC Gastroenterol 3.067 中国人民解放军总医院普外科
28 CircRNA VPRBP通过miR-93-5p/FRMD6轴抑制宫颈癌的致瘤性 CircRNA VPRBP inhibits tumorigenicity of cervical cancer via miR-93-5p/FRMD6 axis Reprod Sci 3.06 川北医学院附属医院
29 Hsa_circ_0023984通过调控miR-1294/PI3K/Akt/c-Myc通路调控食管鳞癌细胞的增殖、迁移和侵袭 Hsa_circ_0023984 Regulates Cell Proliferation, Migration, and Invasion in Esophageal Squamous Cancer via Regulating miR-1294/PI3K/Akt/c-Myc Pathway Appl Biochem Biotechnol 2.926 郑州大学第一附属医院肿瘤科
30 环状RNA hsa_circ_0004396作为miR-615-5p的海绵,通过上调P21-Activated Kinase 1促进非小细胞肺癌进展和放射耐药 Circular RNA hsa_circ_0004396 acts as a sponge of miR-615-5p to promote non-small cell lung cancer progression and radioresistance through the upregulation of P21-Activated Kinase 1 J Clin Lab Anal 2.352 甘肃省肿瘤医院抽吸肿瘤科
31 在肾细胞癌中,环状RNA circSDHC (hsa_circ_0015004)通过调控中心体蛋白55的表达调控肿瘤生长和血管生成 Circular RNA circSDHC (hsa_circ_0015004) regulates tumor growth and angiogenesis via regulating centrosomal protein 55 expression in renal cell carcinoma Histol Histopathol 2.303 河北医科大学第四医院泌尿外科
32 麻醉异丙酚在体外通过下调circ-MEMO1-miR-485-3p-NEK4 ceRNA轴抑制肺腺癌的生长和转移 Anesthetic propofol suppresses growth and metastasis of lung adenocarcinoma in vitro through downregulating circ-MEMO1-miR-485-3p-NEK4 ceRNA axis Histol Histopathol 2.303 河北大学附属医院麻醉科
33 溴氰菊酯敏感和抗性淡色库蚊CircRNA的表达谱(双翅目:库蚊科) CircRNA expression profiles in deltamethrin-susceptible and -resistant Culex pipiens pallens (Diptera: Culicidae) Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol 2.231 南京中医药大学,南京医科大学

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