欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计33篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.circRNA/Wnt轴在癌症中的功能作用
标题:The functional roles of the circRNA/Wnt axis in cancer
杂志:Molecular Cancer
影响因子:27.401
通讯作者:李兰娟院士和Lu Juan(浙江大学医学院附属第一医院)
环状RNAs是共价闭合的非编码RNAs,在从病毒到植物到哺乳动物的广泛物种中广泛表达。环状RNAs在Wnt通路中富集。异常的Wnt通路激活参与了各种类型癌症的发生发展。越来越多的证据表明,circRNA/Wnt轴调节癌症相关基因的表达,进而调控癌症的进展。Wnt通路相关circRNA表达与许多临床特征明显相关。circRNA可以通过与Wnt通路相互作用来调节细胞的生物学功能。此外,Wnt通路相关的环状RNAs在癌症诊断、预后评估和治疗方面是很有前途的潜在生物标志物。本文就Wnt通路相关环状RNAs在肿瘤发生发展中的作用及临床应用的研究进展进行综述。
Wnt信号通路的分类
2.m6a介导的circMDK上调促进了肿瘤的发生,并作为肝细胞癌的纳米治疗靶点
标题:M6A-mediated upregulation of circMDK promotes tumorigenesis and acts as a nanotherapeutic target in hepatocellular carcinoma
杂志:Molecular Cancer
影响因子:27.401
通讯作者:夏赞贤教授(中南大学生命科学学院)
背景:新证据表明环状RNAs(CircRNAs)在疾病发展中起着关键作用,尤其是在各种癌症中。然而,CircRNA在肝细胞癌(HCC)中的致癌性作用仍不清楚。
方法:进行RNA测序以确定成对HCC组织和非肿瘤组织中显著上调的CircRNA。CCK-8分析、集落形成、transwell和异种移植小鼠模型用于研究CircRNA在肝癌增殖和转移中的作用。用小干扰RNA(siRNA)沉默基因表达。RNA免疫沉淀、生物素下拉、RNA下拉、荧光素酶报告分析和western blot用于探索潜在的分子机制。
结果:来源于MDK基因第5外显子(命名为circMDK)的Hsa_circ_0095868被鉴定为一种新的致癌circRNA,在HCC中显著上调。circMDK的上调与N6甲基腺苷(m6A)的修饰和肝癌患者的低生存率有关。在机制上,circMDK吸收miR-346和miR-874-3p上调ATG16L1(自噬相关的16-Like 1),从而激活PI3K/AKT/mTOR信号通路,促进细胞增殖、迁移和侵袭。合成了聚(β-氨基酯)(PAEs)来辅助circMDK-siRNA(PAE-siRNA)的递送,在包括皮下、转移、原位和患者源性异种移植(PDX)模型在内的四种肝脏肿瘤模型中,该siRNA有效地抑制了肿瘤的进展,且没有明显的副作用。
结论:CircMDK可作为一种潜在的肿瘤生物标志物,通过miR-346/874-3p-ATG16L1轴促进HCC的进展。基于PAE的siRNA递送提高了靶向circMDK的siRNA的稳定性和效率。PAE-siRNA纳米粒在体内有效抑制肝癌的增殖和转移。为肝癌的治疗提供了一种有前途的纳米治疗策略。
图文摘要
3.环状RNA circHMGB2通过miR-181a-5p/CARM1轴驱动肺腺癌和鳞状细胞癌的免疫抑制和抗PD-1耐药性
标题:The circular RNA circHMGB2 drives immunosuppression and anti-PD-1 resistance in lung adenocarcinomas and squamous cell carcinomas via the miR-181a-5p/CARM1 axis
杂志:Molecular Cancer
影响因子:27.401
通讯作者:吴永兵主任医师(南昌大学第二附属医院心脏大血管外科)
背景:之前的研究已经证实HMGB2在各种癌症中的致癌作用,但HMGB2衍生的CircRNA的生物学功能仍然未知。因此,本研究探究了HMGB2衍生的CircRNA在肺腺癌(LUAD)和鳞状细胞癌(LUSC)中的潜在作用。
方法:使用qRT–PCR评估HMGB2衍生的CircRNA在LUAD和LUSC组织以及匹配的正常组织中的表达谱。在体外,通过Transwell、CCK-8、流式细胞术和免疫组织化学分析,以及在免疫小鼠模型和人源化小鼠模型中,确定circHMGB2在LUAD和LUSC进展中的作用。此外,还进行了体内circRNA沉淀试验、荧光素酶报告试验和RNA下拉试验,以探索circHMGB2促进LUAD和LUSC抗PD-1耐药性的潜在机制。
结果:circHMGB2(hsa_circ_0071452)在NSCLC组织中的表达显著上调,生存分析表明circHMGB2是LUAD和LUSC患者预后不良的独立指标。研究发现circHMGB2对LUAD和LUSC细胞的增殖有轻微影响,但在免疫活性小鼠模型和人源化小鼠模型中,circHMGB2通过促进抗肿瘤免疫的耗尽,显著重塑了肿瘤微环境。从机制上讲,circHMGB2通过吸附miR-181a-5p来缓解下游CARM1的抑制,从而使LUAD和LUSC中的1型干扰素反应失活。此外,发现circHMGB2表达的上调降低了抗PD-1治疗的疗效,CARM1抑制剂EZM2302和抗PD-1抗体的组合在临床前模型中发挥了良好的协同效应。
结论:circHMGB2的过度表达主要通过重塑LUAD和LUSC患者的肿瘤微环境和调节抗PD-1耐药性来促进LUAD和LUSC的进展。本研究为LUAD和LUSC治疗提供了一种新策略。
circHMGB2通过海绵机制参与肿瘤免疫和PD-1耐药
4.序列元件对线性和环状RNAs亚细胞定位的上下文特异性影响
标题:Context-specific effects of sequence elements on subcellular localization of linear and circular RNAs
杂志:Nat Commun
影响因子:14.919
通讯作者:Igor Ulitsky(以色列魏兹曼科学院生物调控与分子神经科学系)
长RNA在转录后的命运变化很大,这种变化部分归因于短序列元件。使用大量平行RNA分析来研究来自非编码RNA的序列如何影响环状和线性RNA的亚细胞定位和稳定性,包括剪接和未剪接形式。结果发现,序列元素的作用强烈依赖于宿主RNA上下文,驱动线性和环状RNA核富集的序列之间重叠有限。特异性RNA结合蛋白的结合支持了其中一些差异——srsf1结合导致环状RNA的核富集;SAFB结合与主要不剪接的线性RNA的核富集有关;IGF2BP1促进线性剪接RNA分子的输出。因此,长RNA转录后的命运取决于特定序列元件的组合贡献、剪接以及线性RNA特有的末端特征的存在。
基因干扰后的文库构建
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | circRNA/Wnt轴在癌症中的功能作用 | The functional roles of the circRNA/Wnt axis in cancer | Mol Cancer | 27.401 | 浙江大学医学院第一附属医院 |
2 | m6a介导的circMDK上调促进了肿瘤的发生,并作为肝细胞癌的纳米治疗靶点 | M6A-mediated upregulation of circMDK promotes tumorigenesis and acts as a nanotherapeutic target in hepatocellular carcinoma | Mol Cancer | 27.401 | 中南大学生命科学学院 |
3 | 在肺腺癌和鳞状细胞癌中,环状RNA circHMGB2通过miR-181a-5p/CARM1轴驱动免疫抑制和抗pd -1耐药性 | The circular RNA circHMGB2 drives immunosuppression and anti-PD-1 resistance in lung adenocarcinomas and squamous cell carcinomas via the miR-181a-5p/CARM1 axis | Mol Cancer | 27.401 | 南昌大学第二附属医院心胸外科 |
4 | 序列元件对线性和环状RNAs亚细胞定位的上下文特异性影响 | Context-specific effects of sequence elements on subcellular localization of linear and circular RNAs | Nat Commun | 14.919 | 以色列魏兹曼科学院生物调控与分子神经科学系 |
5 | EIF4A3诱导的circTOLLIP通过miR-516a-5p/PBX3/EMT通路促进肝细胞癌的进展 | EIF4A3-induced circTOLLIP promotes the progression of hepatocellular carcinoma via the miR-516a-5p/PBX3/EMT pathway | J Exp Clin Cancer Res | 11.161 | 华中科技大学同济医学院同济医院 |
6 | EIF4A3调控的circ_0087429可以通过mirR-5003-3p依赖的OGN表达上调逆转EMT,抑制宫颈癌的进展 | EIF4A3-regulated circ_0087429 can reverse EMT and inhibit the progression of cervical cancer via miR-5003-3p-dependent upregulation of OGN expression | J Exp Clin Cancer Res | 11.161 | 同济大学医学院 |
7 | circHIPK3对miR-30c/DLL4轴的失调对KSHV溶解复制至关重要 | Dysregulation of the miR-30c/DLL4 axis by circHIPK3 is essential for KSHV lytic replication | EMBO Rep | 8.807 | 英国利兹大学,南非罗德大学 |
8 | 在肾细胞癌中,环状RNA circVAMP3通过调节LDHA促进有氧糖酵解和增殖 | Circular RNA circVAMP3 promotes aerobic glycolysis and proliferation by regulating LDHA in renal cell carcinoma | Cell Death Dis | 8.469 | 中山大学孙逸仙纪念医院,中山大学附属第七医院 |
9 | 登革热发病机制中的宿主和病毒非编码RNAs | Host and viral non-coding RNAs in dengue pathogenesis | Rev Med Virol | 6.989 | 印度博帕尔科学教育和研究所生物科学系 |
10 | 外泌体环状RNAs在实体癌和恶性血液病中的研究进展 | The emerging landscape of exosomal CircRNAs in solid cancers and hematological malignancies | Biomark Res | 6.148 | 浙江大学医学院附属第一医院,江苏大学附属人民医院 |
11 | ncRNAs介导的TIMM8A高表达与预后不良相关,并作为乳腺癌的致癌基因 | ncRNAs-mediated high expression of TIMM8A correlates with poor prognosis and act as an oncogene in breast cancer | Cancer Cell Int | 5.722 | 南京医科大学第一附属医院,苏州大学附属第一医院 |
12 | 在狼疮性肾炎中,CircRTN4通过激活miR-513a-5p/FN轴加重系膜细胞功能障碍 | CircRTN4 aggravates mesangial cell dysfunction by activating the miR-513a-5p/FN axis in lupus nephritis | Lab Invest | 5.662 | 河北医科大学 |
13 | 全转录组测序识别与原因不明的复发性妊娠流产相关的关键mRNAs、miRNAs、lncRNAs和环状RNAs | Whole-transcriptome sequencing identifies key mRNAs, miRNAs, lncRNAs, and circRNAs associated with unexplained recurrent pregnancy loss | Cell Tissue Res | 5.249 | 南京医科大学附属妇产医院 |
14 | circDHTKD1通过上调CXCL5促进膀胱癌的淋巴转移 | circDHTKD1 promotes lymphatic metastasis of bladder cancer by upregulating CXCL5 | Cell Death Discov | 5.241 | 南京大学医学院附属鼓楼医院 |
15 | Circ_0000811可作为miR-15b海绵,抑制prkar2a介导的JAK2/STAT1通路,减轻脑缺血眩晕 | Circ_0000811 acts as a miR-15b sponge and inhibits Prkar2a-mediated JAK2/STAT1 pathway to attenuate cerebral ischemic vertigo | Cell Death Discov | 5.241 | 中国医科大学附属盛京医院神经内科 |
16 | 多个茎环引物诱导级联环介导等温扩增直接识别和特异性检测环状RNAs | Multiple stem-loop primers induced cascaded loop-mediated isothermal amplification for direct recognition and specific detection of circular RNAs | Analyst | 4.616 | 北京科技大学材料科学与工程学院 |
17 | 从比较研究起源于哺乳动物ATXN2L内含子的环状RNA到理解内含子环状rna的起源 | From the comparative study of a circRNA originating from an mammalian ATXN2L intron to understanding the genesis of intron lariat-derived circRNAs | Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech | 4.490 | 罗斯托克大学农业与环境科学学院 |
18 | CircRNA CDR1as通过激活hippo信号通路促进糖尿病心肌病心肌细胞凋亡 | CircRNA CDR1as promotes cardiomyocyte apoptosis through activating hippo signaling pathway in diabetic cardiomyopathy | Eur J Pharmacol | 4.432 | 哈尔滨医科大学药学院 |
19 | 与麻风分枝杆菌感染相关的骨细胞样细胞环状RNA – miRNA – mRNA网络的综合分析 | A comprehensive analysis of the circRNA-miRNA-mRNA network in osteocyte-like cell associated with Mycobacterium leprae infection | PLoS Negl Trop Dis | 4.411 | 中南大学湘雅二医院 |
20 | 利用定量PCR技术对血液中mRNAs降解动力学及microRNAs、circRNAs、lncRNAs半衰期的影响因素进行了研究 | Factors influencing degradation kinetics of mRNAs and half-lives of microRNAs, circRNAs, lncRNAs in blood in vitro using quantitative PCR | Sci Rep | 4.379 | 大连医科大学医学检验学院 |
21 | 结合circRNA、miRNA和mRNA分析揭示ceRNA在从胚胎到孵化后鸡肌肉发育中的调控作用 | Integrative analysis of circRNA, miRNA, and mRNA profiles to reveal ceRNA regulation in chicken muscle development from the embryonic to post-hatching periods | BMC Genomics | 3.969 | 山东省农业科学院家禽研究所 |
22 | 转录因子ZEB1通过促进CircANKRD17的转录而介导上皮性卵巢癌的进展 | The transcription factor ZEB1 mediates the progression of epithelial ovarian cancer by promoting the transcription of CircANKRD17 | J Biochem Mol Toxicol | 3.642 | 锦州医科大学附属第一医院妇产科 |
23 | Circ_0005231通过海绵化miR-383-5p和调控KIAA0101促进食管鳞癌的进展 | Circ_0005231 promotes the progression of esophageal squamous cell carcinoma via sponging miR-383-5p and regulating KIAA0101 | Thorac Cancer | 3.500 | 河北医科大学第四医院胸外科 |
24 | 基于高通量测序的糖尿病circRNA-mRNA表达谱和功能富集分析 | Analysis of circRNA-mRNA expression profiles and functional enrichment in diabetes mellitus based on high throughput sequencing | Int Wound J | 3.315 | 北京大学国际医院神经外科 |
25 | 通过图注意自动编码器预测环状RNA -药物敏感性关联 | Predicting circRNA-drug sensitivity associations via graph attention auto-encoder | BMC Bioinformatics | 3.169 | 河南城建学院计算机与数据科学学院 |
26 | CircMiMi:构建环RNA-microRNA-mRNA跨物种相互作用的独立软件 | CircMiMi: a stand-alone software for constructing circular RNA-microRNA-mRNA interactions across species | BMC Bioinformatics | 3.169 | 台湾中央研究院基因组学研究中心 |
27 | CircRNA circ-ATAD1抑制miR-618成熟参与结直肠癌 | CircRNA circ-ATAD1 suppresses miR-618 maturation to participate in colorectal cancer | BMC Gastroenterol | 3.067 | 中国人民解放军总医院普外科 |
28 | CircRNA VPRBP通过miR-93-5p/FRMD6轴抑制宫颈癌的致瘤性 | CircRNA VPRBP inhibits tumorigenicity of cervical cancer via miR-93-5p/FRMD6 axis | Reprod Sci | 3.06 | 川北医学院附属医院 |
29 | Hsa_circ_0023984通过调控miR-1294/PI3K/Akt/c-Myc通路调控食管鳞癌细胞的增殖、迁移和侵袭 | Hsa_circ_0023984 Regulates Cell Proliferation, Migration, and Invasion in Esophageal Squamous Cancer via Regulating miR-1294/PI3K/Akt/c-Myc Pathway | Appl Biochem Biotechnol | 2.926 | 郑州大学第一附属医院肿瘤科 |
30 | 环状RNA hsa_circ_0004396作为miR-615-5p的海绵,通过上调P21-Activated Kinase 1促进非小细胞肺癌进展和放射耐药 | Circular RNA hsa_circ_0004396 acts as a sponge of miR-615-5p to promote non-small cell lung cancer progression and radioresistance through the upregulation of P21-Activated Kinase 1 | J Clin Lab Anal | 2.352 | 甘肃省肿瘤医院抽吸肿瘤科 |
31 | 在肾细胞癌中,环状RNA circSDHC (hsa_circ_0015004)通过调控中心体蛋白55的表达调控肿瘤生长和血管生成 | Circular RNA circSDHC (hsa_circ_0015004) regulates tumor growth and angiogenesis via regulating centrosomal protein 55 expression in renal cell carcinoma | Histol Histopathol | 2.303 | 河北医科大学第四医院泌尿外科 |
32 | 麻醉异丙酚在体外通过下调circ-MEMO1-miR-485-3p-NEK4 ceRNA轴抑制肺腺癌的生长和转移 | Anesthetic propofol suppresses growth and metastasis of lung adenocarcinoma in vitro through downregulating circ-MEMO1-miR-485-3p-NEK4 ceRNA axis | Histol Histopathol | 2.303 | 河北大学附属医院麻醉科 |
33 | 溴氰菊酯敏感和抗性淡色库蚊CircRNA的表达谱(双翅目:库蚊科) | CircRNA expression profiles in deltamethrin-susceptible and -resistant Culex pipiens pallens (Diptera: Culicidae) | Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol | 2.231 | 南京中医药大学,南京医科大学 |