欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计28篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1.circEXOC6B与mTORC1激活剂RRAGB相互作用,通过拮抗HIF1A -RRAGB-mTORC1正反馈环抑制结直肠癌的进展

标题:circEXOC6B interacting with RRAGB, an mTORC1 activator, inhibits the progression of colorectal cancer by antagonizing the HIF1A-RRAGB-mTORC1 positive feedback loop

杂志:Mol Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:李学农教授(南方医科大学病理科)

背景:近年来,越来越多的研究表明,环状RNA在调控肿瘤发展和化疗耐药中起着重要作用。利用两个高通量RNA测序数据集,先前发现circEXOC6B在结肠癌中下调。然而,其在结直肠癌(CRC)中的作用和机制尚不清楚。

方法:采用实时荧光定量PCR检测CRC组织中circEXOC6B的表达。通过体内和体外功能实验来确定circEXOC6B在结直肠癌进展中的抑制作用。采用RNA下拉法、质谱法、RNA结合蛋白免疫沉淀法、共免疫沉淀法、荧光原位杂交法和免疫荧光法研究circEXOC6B与CRC生长和5-氟尿嘧啶诱导的凋亡的可能机制。采用染色质免疫沉淀、双荧光素酶测定、western blot和免疫组化方法探讨HIF1A调控RRAGB转录的机制。

结果:circEXOC6B在CRC组织中表达下调,其低表达与患者预后不良相关。功能实验表明,circEXOC6B在体外和体内均能抑制CRC细胞的生长,增加5-氟尿嘧啶诱导的细胞凋亡。在机制上,circEXOC6B通过与RRAGB结合抑制其异源二聚体的形成,从而抑制mTORC1通路和HIF1A水平。此外,HIF1A通过与RRAGB启动子区结合,上调RRAGB的转录。综上所述,结果表明HIF1A-RRAGB-mTORC1正反馈回路驱动CRC肿瘤进展,而circEXOC6B可阻断该正反馈回路。

结论:circEXOC6B通过拮抗HIF1A-RRAGB-mTORC1正反馈环,抑制CRC的进展,增强CRC细胞对5-氟尿嘧啶的化学敏感性。circEXOC6B是CRC治疗可能的治疗靶点。

circEXOC6B参与CRC的作用机制

 

2.衰竭的人类心脏中A-to-I RNA编辑的减少调节了环状RNA的形成

标题:Reduction of A-to-I RNA editing in the failing human heart regulates formation of circular RNAs

杂志:Basic Res Cardiol

影响因子:17.165

通讯作者: Jes-Niels Boeckel(Klinik und Poliklinik für Kardiologie)

影响RNA二级结构的RNA编辑改变可导致人类疾病。因此,本文研究了衰竭人类心脏中的RNA编辑。转录组测序显示,腺苷-肌苷(A-I) RNA编辑负责心肌中80%的编辑事件。衰竭的人类心脏的特征是RNA编辑减少。这主要归因于蛋白质编码基因内含子中的Alu元素。与未衰竭的对照组相比,衰竭左心室中166个环状RNAs表达上调,7个环状RNAs表达下调。大部分上调的环状RNA与宿主基因中RNA编辑的减少有关。ADAR2与从A到I编辑的RNA区域结合,在人类衰竭的心脏中下降。在体外,ADAR2的降低增加了circRNA水平,这表明在衰竭的人类心脏中,ADAR2水平的降低对circRNA的增加产生了因果效应。为了深入了解其机制,作者进一步鉴定了心衰中编辑高度减少的上调环状RNAs之一AKAP13。ADAR2减少了AKAP13 pre-mRNA中双链结构的形成,从而降低了Alu元素的稳定性和由此产生的环状RNAs的环状化。过表达circAKAP13可损害人诱导多能干细胞来源的心肌细胞的肌节规律性。这些数据表明,ADAR2介导了人类心脏中的A-to-I RNA编辑。A-to-I RNA编辑抑制Alu元素dsRNA结构的形成,有利于典型线性mRNA剪接,抑制环状RNA的形成。这些发现与RNA编辑减少和环状RNA水平增加的疾病相关,并为环状RNA形成的人类特异性调控提供了见解。

HF患者(n=20)和对照组(n=10)中重复Alu序列的全基因组RNA编辑事件

 

3.CRISPR/Cas13效应物有不同程度的脱靶效应,限制了它们在真核细胞中的应用

标题:CRISPR/Cas13 effectors have differing extents of off-target effects that limit their utility in eukaryotic cells

杂志:Nucleic Acids Res

影响因子:16.971

通讯作者:Jeremy E Wilusz(宾夕法尼亚大学)

CRISPR/Cas13效应器作为一种易于定制的检测和敲低RNA的工具,已经获得了越来越多的关注。Cas13核糖核酸酶活性的激活需要目标RNA和Cas13相关的引导RNA之间近乎完美的互补。尽管如此,真核细胞中Cas13效应物的特异性一直存在争议,因为Cas13核酸酶域可以暴露在酶表面,为附近RNA的混杂切割提供了可能(所谓的附带损伤)。在这里,通过对果蝇和人类细胞的共转染实验,作者发现RxCas13d(一种常用的Cas13效应因子)的脱靶效应可以与靶RNA敲除水平一样强。脱靶效应程度与靶RNA表达水平呈正相关,降低RxCas13d/guide RNA水平仍可观察到附带损伤。与RxCas13d不同的是,PspCas13b效应物表现出了更好的特异性,它可以用来敲除果蝇的环状RNA,而不影响相关线性RNA的表达。尽管如此,PspCas13b仍然可以产生脱靶效应,研究发现,Cas13效应物脱靶效应的程度取决于检测的细胞类型和靶RNA。总之,这些结果强调了在设计和解释基于cas13的敲除实验时需要谨慎。

 

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 circEXOC6B与mTORC1激活剂RRAGB相互作用,通过拮抗HIF1A -RRAGB-mTORC1正反馈环抑制结直肠癌的进展 circEXOC6B interacting with RRAGB, an mTORC1 activator, inhibits the progression of colorectal cancer by antagonizing the HIF1A-RRAGB-mTORC1 positive feedback loop Mol Cancer 27.401 南方医科大学
2 衰竭的人类心脏中A-to-I RNA编辑的减少调节了环状RNA的形成 Reduction of A-to-I RNA editing in the failing human heart regulates formation of circular RNAs Basic Res Cardiol 17.165 Klinik und Poliklinik für Kardiologie
3 CRISPR/Cas13效应物有不同程度的脱靶效应,限制了它们在真核细胞中的应用 CRISPR/Cas13 effectors have differing extents of off-target effects that limit their utility in eukaryotic cells Nucleic Acids Res 16.971 宾夕法尼亚大学
4 环状RNA在胰腺癌中的生物学功能、机制及临床意义:一颗有希望的新星 Biological functions, mechanisms, and clinical significance of circular RNA in pancreatic cancer: a promising rising star Cell Biosci 7.133 南京医科大学第一附属医院胰腺中心
5 Circ-HSP90A通过调控STAT3信号和PD-1/PD-L1检查点加速非小细胞肺癌的细胞生长、干细胞生长和免疫逃避 Circ-HSP90A expedites cell growth, stemness, and immune evasion in non-small cell lung cancer by regulating STAT3 signaling and PD-1/PD-L1 checkpoint Cancer Immunol Immunother 6.968 空军医科大学第二附属医院
6 n6 -甲基腺苷修饰的环状rna RERE通过调节β-catenin泛素化和降解调节骨关节炎 N 6 -methyladenosine-modified circRNA RERE modulates osteoarthritis by regulating β-catenin ubiquitination and degradation Cell Prolif 6.831 东南大学
7 肌肉骨骼疾病中n6 -甲基腺苷甲基化和非编码RNAs相互作用的新见解 Novel insights into the interaction between N6-methyladenosine methylation and noncoding RNAs in musculoskeletal disorders Cell Prolif 6.831 沈阳体育大学,上海体育学院
8 circ_0003204通过miR-370-3p/HDAC4轴调控人脂肪源性干细胞的成骨分化 circ_0003204 regulates the osteogenic differentiation of human adipose-derived stem cells via miR-370-3p/HDAC4 axis Int J Oral Sci 6.344 四川大学华西口腔医院
9 通过调控miR-486-3p/eIF5A轴介导的干性,环状RNA EPB41表达可预测NSCLC的不良预后 Circular RNA EPB41 expression predicts unfavorable prognoses in NSCLC by regulating miR-486-3p/eIF5A axis-mediated stemness Cancer Cell Int 5.722 上海中医药大学,上海医科大学
10 HNRNPA1负调控circMEF2D通过miR-486-PI3K/AKT轴抑制成肌细胞增殖和分化 circMEF2D Negatively Regulated by HNRNPA1 Inhibits Proliferation and Differentiation of Myoblasts via miR-486-PI3K/AKT Axis J Agric Food Chem 5.279 西北农林科技大学,新疆农业大学
11 Circ-CCNB1通过调节miR-223/SIAH1轴调控自然流产中滋养细胞增殖和侵袭 Circ-CCNB1 modulates trophoblast proliferation and invasion in spontaneous abortion by regulating miR-223/SIAH1 axis Endocrinology 4.736 浙江大学
12 Circ_0060077敲低通过miR-145-5p/VASN通路缓解高糖诱导的HK-2细胞凋亡、氧化应激、炎症和纤维化 Circ_0060077 Knockdown Alleviates High-Glucose-Induced Cell Apoptosis, Oxidative Stress, Inflammation and Fibrosis in HK-2 Cells via miR-145-5p/VASN Pathway Inflammation 4.092 河南科技大学第一附属医院
13 环状RNA hsa_circ_0004381通过miR-185-5p/RAC1轴促进帕金森病细胞模型中的神经元损伤 Circular RNA hsa_circ_0004381 Promotes Neuronal Injury in Parkinson’s Disease Cell Model by miR-185-5p/RAC1 Axis Neurotox Res 3.911 锦州医科大学附属第一医院神经内科
14 Elongator 乙酰转移酶复合物亚基3的环状和线性形式在三阴性乳腺癌进展中的关系 Relation between the circular and linear form of the Elongator Acetyltransferase Complex Subunit 3 in the progression of triple-negative breast cancer Cell Biochem Funct 3.685 库尔德斯坦医科大学,奥胡斯大学
15 Circ-POLR3A通过miR-31/TXNIP信号级联加速TGF-β2诱导的对晶状体上皮细胞活力、迁移和侵袭的促进 Circ-POLR3A accelerates TGF-β2-induced promotion in cell viability, migration, and invasion of lens epithelial cells via miR-31/TXNIP signaling cascade J Biochem Mol Toxicol 3.642 郑州大学第一附属医院眼科
16 CircDLG1通过调控miR-630/CENPF轴促进非小细胞肺癌恶性发展 CircDLG1 promotes malignant development of non-small cell lung cancer through regulation of the miR-630/CENPF axis Strahlenther Onkol 3.621 中国医科大学盛京医院
17 基于挂锁探针和滚环扩增的环状RNA原位杂交显示技术 In situ hybridization assay for circular RNA visualization based on padlock probe and rolling circle amplification Biochem Biophys Res Commun 3.575 华侨大学医学院暨生物医学学院
18 在NASH相关纤维化中,CircRNA608-microRNA222-PINK1轴调控肝星状细胞线粒体自噬 CircRNA608-microRNA222-PINK1 axis regulates the mitophagy of hepatic stellate cells in NASH related fibrosis Biochem Biophys Res Commun 3.575 同济大学医学院上海东方医院消化内科
19 发情期和发情期湘猪卵巢中的环状RNAs CircRNAs in Xiang pig ovaries among diestrus and estrus stages Porcine Health Manag 3.048 贵州大学生命科学学院
20 Circular RNA circTLK1通过靶向miR-26a-5p/DAPK1调控帕金森病中多巴胺能神经元损伤 Circular RNA circTLK1 regulates dopaminergic neuron injury during Parkinson’s disease by targeting miR-26a-5p/DAPK1 Neurosci Lett 3.046 同济大学医学院上海东方医院放射科
21 CircCDK14通过miR-1183/KLF5通路改善骨关节炎中白细胞介素-1β诱导的软骨细胞损伤 CircCDK14 ameliorates interleukin-1β-induced chondrocyte damage by the miR-1183/KLF5 pathway in osteoarthritis Autoimmunity 2.815 长治医学院附属和平医院
22 Circ_0017274作用于miR-637/CDX2轴,促进胃癌顺铂耐药 Circ_0017274 acts on miR-637/CDX2 axis to facilitate cisplatin resistance in gastric cancer Clin Exp Pharmacol Physiol 2.557 连云港市第一人民医院
23 环状RNAs:多发性骨髓瘤的新治疗靶点 CircRNAs: novel therapeutic targets in multiple myeloma Mol Biol Rep 2.316 海军医科大学附属上海长征医院
24 类风湿关节炎成纤维细胞样滑膜细胞通过cirs -7依赖的miR-7调控维持肿瘤样生物学特性 Rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes maintain tumor-like biological characteristics through ciRS-7-dependent regulation of miR-7 Mol Biol Rep 2.316 中山大学附属第三医院风湿病科
25 七氟烷通过circ_0001649/miR-19a-3p/SGTB轴抑制肝癌细胞进展 Sevoflurane suppresses hepatocellular carcinoma cell progression via circ_0001649/miR-19a-3p/SGTB axis Histol Histopathol 2.303 郑州大学附属郑州中心医院
26 沉默CircEIF3I/miR-526b-5p轴表观遗传学靶向HGF/c-Met信号阻碍肝细胞癌的恶性生长、转移和血管生成 Silencing CircEIF3I/miR-526b-5p Axis Epigenetically Targets HGF/c-Met Signal to Hinder the Malignant Growth, Metastasis and Angiogenesis of Hepatocellular Carcinoma Biochem Genet 1.890 吉林大学第二医院检验科
27 Hsa_circ_0000437通过miR-626/CDKN1B轴抑制子宫内膜癌的发生发展 Hsa_circ_0000437 inhibits the development of endometrial carcinoma through miR-626/CDKN1B axis Protein Pept Lett 1.890 陕西中医药大学附属第二医院
28 Circ_0000705通过靶向miR-621/PYCR1轴促进食管鳞癌细胞脯氨酸代谢 Circ_0000705 facilitates proline metabolism of esophageal squamous cell carcinoma cells by targeting miR-621/PYCR1 axis Discov Oncol Not Found 台州大学附属台州中心医院

 

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