欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计28篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.circEXOC6B与mTORC1激活剂RRAGB相互作用,通过拮抗HIF1A -RRAGB-mTORC1正反馈环抑制结直肠癌的进展
标题:circEXOC6B interacting with RRAGB, an mTORC1 activator, inhibits the progression of colorectal cancer by antagonizing the HIF1A-RRAGB-mTORC1 positive feedback loop
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.401
通讯作者:李学农教授(南方医科大学病理科)
背景:近年来,越来越多的研究表明,环状RNA在调控肿瘤发展和化疗耐药中起着重要作用。利用两个高通量RNA测序数据集,先前发现circEXOC6B在结肠癌中下调。然而,其在结直肠癌(CRC)中的作用和机制尚不清楚。
方法:采用实时荧光定量PCR检测CRC组织中circEXOC6B的表达。通过体内和体外功能实验来确定circEXOC6B在结直肠癌进展中的抑制作用。采用RNA下拉法、质谱法、RNA结合蛋白免疫沉淀法、共免疫沉淀法、荧光原位杂交法和免疫荧光法研究circEXOC6B与CRC生长和5-氟尿嘧啶诱导的凋亡的可能机制。采用染色质免疫沉淀、双荧光素酶测定、western blot和免疫组化方法探讨HIF1A调控RRAGB转录的机制。
结果:circEXOC6B在CRC组织中表达下调,其低表达与患者预后不良相关。功能实验表明,circEXOC6B在体外和体内均能抑制CRC细胞的生长,增加5-氟尿嘧啶诱导的细胞凋亡。在机制上,circEXOC6B通过与RRAGB结合抑制其异源二聚体的形成,从而抑制mTORC1通路和HIF1A水平。此外,HIF1A通过与RRAGB启动子区结合,上调RRAGB的转录。综上所述,结果表明HIF1A-RRAGB-mTORC1正反馈回路驱动CRC肿瘤进展,而circEXOC6B可阻断该正反馈回路。
结论:circEXOC6B通过拮抗HIF1A-RRAGB-mTORC1正反馈环,抑制CRC的进展,增强CRC细胞对5-氟尿嘧啶的化学敏感性。circEXOC6B是CRC治疗可能的治疗靶点。
circEXOC6B参与CRC的作用机制
2.衰竭的人类心脏中A-to-I RNA编辑的减少调节了环状RNA的形成
标题:Reduction of A-to-I RNA editing in the failing human heart regulates formation of circular RNAs
杂志:Basic Res Cardiol
影响因子:17.165
通讯作者: Jes-Niels Boeckel(Klinik und Poliklinik für Kardiologie)
影响RNA二级结构的RNA编辑改变可导致人类疾病。因此,本文研究了衰竭人类心脏中的RNA编辑。转录组测序显示,腺苷-肌苷(A-I) RNA编辑负责心肌中80%的编辑事件。衰竭的人类心脏的特征是RNA编辑减少。这主要归因于蛋白质编码基因内含子中的Alu元素。与未衰竭的对照组相比,衰竭左心室中166个环状RNAs表达上调,7个环状RNAs表达下调。大部分上调的环状RNA与宿主基因中RNA编辑的减少有关。ADAR2与从A到I编辑的RNA区域结合,在人类衰竭的心脏中下降。在体外,ADAR2的降低增加了circRNA水平,这表明在衰竭的人类心脏中,ADAR2水平的降低对circRNA的增加产生了因果效应。为了深入了解其机制,作者进一步鉴定了心衰中编辑高度减少的上调环状RNAs之一AKAP13。ADAR2减少了AKAP13 pre-mRNA中双链结构的形成,从而降低了Alu元素的稳定性和由此产生的环状RNAs的环状化。过表达circAKAP13可损害人诱导多能干细胞来源的心肌细胞的肌节规律性。这些数据表明,ADAR2介导了人类心脏中的A-to-I RNA编辑。A-to-I RNA编辑抑制Alu元素dsRNA结构的形成,有利于典型线性mRNA剪接,抑制环状RNA的形成。这些发现与RNA编辑减少和环状RNA水平增加的疾病相关,并为环状RNA形成的人类特异性调控提供了见解。
HF患者(n=20)和对照组(n=10)中重复Alu序列的全基因组RNA编辑事件
3.CRISPR/Cas13效应物有不同程度的脱靶效应,限制了它们在真核细胞中的应用
标题:CRISPR/Cas13 effectors have differing extents of off-target effects that limit their utility in eukaryotic cells
杂志:Nucleic Acids Res
影响因子:16.971
通讯作者:Jeremy E Wilusz(宾夕法尼亚大学)
CRISPR/Cas13效应器作为一种易于定制的检测和敲低RNA的工具,已经获得了越来越多的关注。Cas13核糖核酸酶活性的激活需要目标RNA和Cas13相关的引导RNA之间近乎完美的互补。尽管如此,真核细胞中Cas13效应物的特异性一直存在争议,因为Cas13核酸酶域可以暴露在酶表面,为附近RNA的混杂切割提供了可能(所谓的附带损伤)。在这里,通过对果蝇和人类细胞的共转染实验,作者发现RxCas13d(一种常用的Cas13效应因子)的脱靶效应可以与靶RNA敲除水平一样强。脱靶效应程度与靶RNA表达水平呈正相关,降低RxCas13d/guide RNA水平仍可观察到附带损伤。与RxCas13d不同的是,PspCas13b效应物表现出了更好的特异性,它可以用来敲除果蝇的环状RNA,而不影响相关线性RNA的表达。尽管如此,PspCas13b仍然可以产生脱靶效应,研究发现,Cas13效应物脱靶效应的程度取决于检测的细胞类型和靶RNA。总之,这些结果强调了在设计和解释基于cas13的敲除实验时需要谨慎。
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | circEXOC6B与mTORC1激活剂RRAGB相互作用,通过拮抗HIF1A -RRAGB-mTORC1正反馈环抑制结直肠癌的进展 | circEXOC6B interacting with RRAGB, an mTORC1 activator, inhibits the progression of colorectal cancer by antagonizing the HIF1A-RRAGB-mTORC1 positive feedback loop | Mol Cancer | 27.401 | 南方医科大学 |
2 | 衰竭的人类心脏中A-to-I RNA编辑的减少调节了环状RNA的形成 | Reduction of A-to-I RNA editing in the failing human heart regulates formation of circular RNAs | Basic Res Cardiol | 17.165 | Klinik und Poliklinik für Kardiologie |
3 | CRISPR/Cas13效应物有不同程度的脱靶效应,限制了它们在真核细胞中的应用 | CRISPR/Cas13 effectors have differing extents of off-target effects that limit their utility in eukaryotic cells | Nucleic Acids Res | 16.971 | 宾夕法尼亚大学 |
4 | 环状RNA在胰腺癌中的生物学功能、机制及临床意义:一颗有希望的新星 | Biological functions, mechanisms, and clinical significance of circular RNA in pancreatic cancer: a promising rising star | Cell Biosci | 7.133 | 南京医科大学第一附属医院胰腺中心 |
5 | Circ-HSP90A通过调控STAT3信号和PD-1/PD-L1检查点加速非小细胞肺癌的细胞生长、干细胞生长和免疫逃避 | Circ-HSP90A expedites cell growth, stemness, and immune evasion in non-small cell lung cancer by regulating STAT3 signaling and PD-1/PD-L1 checkpoint | Cancer Immunol Immunother | 6.968 | 空军医科大学第二附属医院 |
6 | n6 -甲基腺苷修饰的环状rna RERE通过调节β-catenin泛素化和降解调节骨关节炎 | N 6 -methyladenosine-modified circRNA RERE modulates osteoarthritis by regulating β-catenin ubiquitination and degradation | Cell Prolif | 6.831 | 东南大学 |
7 | 肌肉骨骼疾病中n6 -甲基腺苷甲基化和非编码RNAs相互作用的新见解 | Novel insights into the interaction between N6-methyladenosine methylation and noncoding RNAs in musculoskeletal disorders | Cell Prolif | 6.831 | 沈阳体育大学,上海体育学院 |
8 | circ_0003204通过miR-370-3p/HDAC4轴调控人脂肪源性干细胞的成骨分化 | circ_0003204 regulates the osteogenic differentiation of human adipose-derived stem cells via miR-370-3p/HDAC4 axis | Int J Oral Sci | 6.344 | 四川大学华西口腔医院 |
9 | 通过调控miR-486-3p/eIF5A轴介导的干性,环状RNA EPB41表达可预测NSCLC的不良预后 | Circular RNA EPB41 expression predicts unfavorable prognoses in NSCLC by regulating miR-486-3p/eIF5A axis-mediated stemness | Cancer Cell Int | 5.722 | 上海中医药大学,上海医科大学 |
10 | HNRNPA1负调控circMEF2D通过miR-486-PI3K/AKT轴抑制成肌细胞增殖和分化 | circMEF2D Negatively Regulated by HNRNPA1 Inhibits Proliferation and Differentiation of Myoblasts via miR-486-PI3K/AKT Axis | J Agric Food Chem | 5.279 | 西北农林科技大学,新疆农业大学 |
11 | Circ-CCNB1通过调节miR-223/SIAH1轴调控自然流产中滋养细胞增殖和侵袭 | Circ-CCNB1 modulates trophoblast proliferation and invasion in spontaneous abortion by regulating miR-223/SIAH1 axis | Endocrinology | 4.736 | 浙江大学 |
12 | Circ_0060077敲低通过miR-145-5p/VASN通路缓解高糖诱导的HK-2细胞凋亡、氧化应激、炎症和纤维化 | Circ_0060077 Knockdown Alleviates High-Glucose-Induced Cell Apoptosis, Oxidative Stress, Inflammation and Fibrosis in HK-2 Cells via miR-145-5p/VASN Pathway | Inflammation | 4.092 | 河南科技大学第一附属医院 |
13 | 环状RNA hsa_circ_0004381通过miR-185-5p/RAC1轴促进帕金森病细胞模型中的神经元损伤 | Circular RNA hsa_circ_0004381 Promotes Neuronal Injury in Parkinson’s Disease Cell Model by miR-185-5p/RAC1 Axis | Neurotox Res | 3.911 | 锦州医科大学附属第一医院神经内科 |
14 | Elongator 乙酰转移酶复合物亚基3的环状和线性形式在三阴性乳腺癌进展中的关系 | Relation between the circular and linear form of the Elongator Acetyltransferase Complex Subunit 3 in the progression of triple-negative breast cancer | Cell Biochem Funct | 3.685 | 库尔德斯坦医科大学,奥胡斯大学 |
15 | Circ-POLR3A通过miR-31/TXNIP信号级联加速TGF-β2诱导的对晶状体上皮细胞活力、迁移和侵袭的促进 | Circ-POLR3A accelerates TGF-β2-induced promotion in cell viability, migration, and invasion of lens epithelial cells via miR-31/TXNIP signaling cascade | J Biochem Mol Toxicol | 3.642 | 郑州大学第一附属医院眼科 |
16 | CircDLG1通过调控miR-630/CENPF轴促进非小细胞肺癌恶性发展 | CircDLG1 promotes malignant development of non-small cell lung cancer through regulation of the miR-630/CENPF axis | Strahlenther Onkol | 3.621 | 中国医科大学盛京医院 |
17 | 基于挂锁探针和滚环扩增的环状RNA原位杂交显示技术 | In situ hybridization assay for circular RNA visualization based on padlock probe and rolling circle amplification | Biochem Biophys Res Commun | 3.575 | 华侨大学医学院暨生物医学学院 |
18 | 在NASH相关纤维化中,CircRNA608-microRNA222-PINK1轴调控肝星状细胞线粒体自噬 | CircRNA608-microRNA222-PINK1 axis regulates the mitophagy of hepatic stellate cells in NASH related fibrosis | Biochem Biophys Res Commun | 3.575 | 同济大学医学院上海东方医院消化内科 |
19 | 发情期和发情期湘猪卵巢中的环状RNAs | CircRNAs in Xiang pig ovaries among diestrus and estrus stages | Porcine Health Manag | 3.048 | 贵州大学生命科学学院 |
20 | Circular RNA circTLK1通过靶向miR-26a-5p/DAPK1调控帕金森病中多巴胺能神经元损伤 | Circular RNA circTLK1 regulates dopaminergic neuron injury during Parkinson’s disease by targeting miR-26a-5p/DAPK1 | Neurosci Lett | 3.046 | 同济大学医学院上海东方医院放射科 |
21 | CircCDK14通过miR-1183/KLF5通路改善骨关节炎中白细胞介素-1β诱导的软骨细胞损伤 | CircCDK14 ameliorates interleukin-1β-induced chondrocyte damage by the miR-1183/KLF5 pathway in osteoarthritis | Autoimmunity | 2.815 | 长治医学院附属和平医院 |
22 | Circ_0017274作用于miR-637/CDX2轴,促进胃癌顺铂耐药 | Circ_0017274 acts on miR-637/CDX2 axis to facilitate cisplatin resistance in gastric cancer | Clin Exp Pharmacol Physiol | 2.557 | 连云港市第一人民医院 |
23 | 环状RNAs:多发性骨髓瘤的新治疗靶点 | CircRNAs: novel therapeutic targets in multiple myeloma | Mol Biol Rep | 2.316 | 海军医科大学附属上海长征医院 |
24 | 类风湿关节炎成纤维细胞样滑膜细胞通过cirs -7依赖的miR-7调控维持肿瘤样生物学特性 | Rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes maintain tumor-like biological characteristics through ciRS-7-dependent regulation of miR-7 | Mol Biol Rep | 2.316 | 中山大学附属第三医院风湿病科 |
25 | 七氟烷通过circ_0001649/miR-19a-3p/SGTB轴抑制肝癌细胞进展 | Sevoflurane suppresses hepatocellular carcinoma cell progression via circ_0001649/miR-19a-3p/SGTB axis | Histol Histopathol | 2.303 | 郑州大学附属郑州中心医院 |
26 | 沉默CircEIF3I/miR-526b-5p轴表观遗传学靶向HGF/c-Met信号阻碍肝细胞癌的恶性生长、转移和血管生成 | Silencing CircEIF3I/miR-526b-5p Axis Epigenetically Targets HGF/c-Met Signal to Hinder the Malignant Growth, Metastasis and Angiogenesis of Hepatocellular Carcinoma | Biochem Genet | 1.890 | 吉林大学第二医院检验科 |
27 | Hsa_circ_0000437通过miR-626/CDKN1B轴抑制子宫内膜癌的发生发展 | Hsa_circ_0000437 inhibits the development of endometrial carcinoma through miR-626/CDKN1B axis | Protein Pept Lett | 1.890 | 陕西中医药大学附属第二医院 |
28 | Circ_0000705通过靶向miR-621/PYCR1轴促进食管鳞癌细胞脯氨酸代谢 | Circ_0000705 facilitates proline metabolism of esophageal squamous cell carcinoma cells by targeting miR-621/PYCR1 axis | Discov Oncol | Not Found | 台州大学附属台州中心医院 |