菜鸡的我，刚把环状RNA的风里雨里的故事弄懂七七八八，ceRNA文章已经漫天飞舞，RBP研究也已经一眼望不到头；心里想着，环状RNA毕竟是非编码，要研究它的翻译还是很难的，文章应该屈指可数。于是，我把键盘敲得哒哒作响，开始搜索环状RNA翻译相关的文章。但不搜不知道，一搜吓一跳：已经有48个环状RNA被发现能够翻译蛋白质并发挥功能，今年已发现了7个！
短短几年，非编码要变成编码了吗？
历史回顾
紧接着2018年，张弩教授团队连发3篇环状RNA翻译蛋白质的文章，证实了内源环状RNA能够在人类组织中表达蛋白质。
本以为后续每年只会零星有一些环状RNA翻译成蛋白质的报道，未曾想到，2021年居然报道了17个环状RNA分子能够翻译成蛋白质并发挥功能！
2021年似乎是环状RNA领域大事件集中的一年，这一年里：
上车还来得及吗
看到这么多环状RNA已被报道能翻译，吓得我赶紧查了一下常用的数据库，看看能翻译的环还剩多少。
通过纳米孔全长环状RNA测序，我们可以看到大量新的环状RNA并未被已知数据库收录。
环状RNA翻译的热度是毋庸置疑的，我想主要有以下几个原因：
• 其次环状RNA转化研究开展的如火如荼，这几年靠体外制备技术以及未来的愿景融资和合作就超过了50亿美元，其中非常重要的一项技术就是让环状RNA持续高效地表达蛋白质；
【Engineering circular RNA for enhanced protein production】将环状RNA蛋白质产量提高了数百倍，能够在体内提供更持久的翻译。该文章发表在了生物技术顶刊Nature Biotechnology。
• 根据已发表的文章来看，环状RNA翻译的新肽参与了重要的生物学通路，例如今年发表的一些内容：
– circINSIG1-121与INSIG1相互作用，促进INSIG1的泛素依赖性降解，从而诱导胆固醇的生物合成。
– circZKSaa与Fbw7复合体与mTOR互作，促进mTOR泛素化降解。
– ……
• 环状RNA CIRC-EXT1编码新蛋白219aa调控膀胱癌发生、发展和肿瘤免疫逃逸的机制研究；
• CIRC-SLC9A6编码新型蛋白在非酒精性脂肪肝病中的作用及m6A修饰对其调控的研究；
• ……
最近，一篇发表在Nature的文章Noncoding translation mitigation在某种程度上解释了研究中的一个现象——大量线索都表明某个circRNA能够翻译蛋白质，但是WB就是做不出来：研究表明，大部分非编码RNA会产生疏水C尾，该部位会被BAG6膜蛋白分流复合物捕获，从而导致蛋白质被蛋白酶体降解。比较巧的是，我可能遇到了一个类似的项目，前期数据都表明circRNA有翻译潜能，但WB无法验证；而circRNA pull-down实验显示环状RNA与核糖体蛋白有结合，并且与许多膜蛋白互作。
如何研究
环状RNA翻译的基本研究套路我还是不愁的，这种随便阅读几篇高分文献就能够总结出来。不过，我发现了一张能够比较系统全面总结该研究过程的图，刚好可以作为参考。
参考文献：Circular RNA translation, a path to hidden proteome
相关阅读：RNC-seq&Ribo-seq
现在上车还来得及！
