结直肠癌(CRC)在全球高发癌症中排名第三,也是癌症相关死亡的第二大原因。CRC的早期发现可以降低发病率和死亡率,但因其早期症状不明显而使许多患者错过早期治疗的有效机会。
环状RNA(circRNA)是具有共价闭环结构的单链RNA,具有高度稳定性、保守性和组织表达特异性。在功能上,circRNA具有miRNA和蛋白质海绵作用,进而间接调控下游靶基因的表达,部分circRNA甚至可以翻译成蛋白质或多肽来发挥生物学功能。近年来,多项研究发现circRNA在CRC的血清、细胞、组织和外泌体中具有表达特异性,表明circRNA对CRC的发展具有重要作用。因此,确定CRC的生物标志物和新型治疗靶点迫在眉睫。显然,circRNA有望成为CRC诊断的潜在标志物和治疗靶点。
2023年6月9日,香港中文大学深圳研究院Wen-Chu Ye在Cell Death & Disease(IF=9.685)发表了综述文章CircRNAs in colorectal cancer: potential biomarkers and therapeutic targets。文章综述了circRNA在CRC的生物发生、表达特征和作用机制,重点介绍了circRNA作为CRC诊断和预后生物标志物以及作为CRC治疗靶点的潜在临床应用。
circRNA的生物发生
circRNA主要由前体RNA通过可变剪切加工产生,目前存在四种环化发生的假设模型(图1),包括:内含子配对驱动环化和RNA结合蛋白(RBP)驱动环化,主要通过反向互补序列(例如Alu元件)之间的碱基对或者RBP形成二聚体成环;此外,外显子跳跃形成的套索和内含子套索驱动环化的方式也能产生环状RNA。
circRNA的生物学功能和机制
众所周知,circRNA具有miRNA和蛋白质海绵作用,进而间接调控下游靶基因的表达。此外,部分circRNA可以翻译成蛋白质或多肽来行使基因表达调控因子的功能(图2)。目前的研究表明,circRNA在临床医学上还具有新兴作用——生物标记物,尤其对癌症的发生和进展具有重要影响。
1、circRNA可以作为miRNA海绵
circRNA作为miRNA海绵,对miRNA在基因表达的转录和转录后控制中发挥作用(例如,影响mRNA的稳定性)。癌细胞的增殖、迁移、侵袭和中性粒细胞分化均涉及该海绵过程有关。
2、circRNA可以作为转录调节因子
circRNA通过与RNA聚合酶II复合物相互作用并翻译多肽来调节基因的转录过程。在各种生理和病理机制中,circRNA主要作为顺式转录调节因子来调控亲本基因转录。
3、circRNA可以与RBP结合
研究发现,具有RBP结合位点的circRNA可以作为蛋白质海绵或诱饵来调节基因表达。circRNA可以直接与一种或几种蛋白质相互作用,并充当“蛋白质支架”的作用,增强了与之直接结合的蛋白质相互作用。与此相反,circRNA还可以通过隔离蛋白质来影响其蛋白互作的稳定性。
4、circRNA可以翻译成多肽和蛋白质
有些circRNA具有开放阅读框(ORF),可以编码蛋白质,而有些circRNA也编码具有肿瘤抑制作用或致癌作用的蛋白质或多肽。circRNA的翻译方式主要分为IRES依赖性或IRES非依赖性翻译(例如,m6A修饰)机制,对人类疾病的诊断和治疗具有重要意义。
CRC中circRNA表达失调和降解机制
随着circRNA在肿瘤发生中的研究越来越火热,许多证据表明,circRNA表达失调与CRC肿瘤的恶性进展密切相关(图3)。例如,circHERC4在CRC组织中的表达水平显著上调,与淋巴结转移和肿瘤晚期发展呈正相关。相反地,circPLCE1在CRC组织中表达下调,与患者生存率低相关。但是,关于circRNA表达失调的机制仍然未知,需要进一步研究。
近年来有研究表明,circRNA降解过程中关键分子的失调可能导致circRNA的异常表达。circRNA呈闭合环状结构,不易被核酸外切酶降解,比线性RNA更加稳定。目前对于其降解机制仍知之甚少。已报道有三种降解方式(图4):
(1)miRNA以互补的方式直接与AGO2切割位点结合,促进circRNA降解;
(2)具有m6A的circRNA通过激活YTHDF2和HRSP12来促进circRNA发生切割;
(3)发生病毒感染时,RNase L能完全降解circRNA。
circRNA作为CRC诊断和治疗的潜在生物标志物
CRC筛查和早期发现对于提高治疗效果和降低CRC相关死亡率至关重要。鉴定基于血液/血清或尿液的表观遗传生物标志物是一种无创且低成本的诊断方式,具有广阔的应用前景。circRNA因其稳定性和表达特异性的特点,且存在于体液中,可以作为CRC诊断的潜在生物标志物。部分circRNA能显著促进CRC细胞增殖、迁移和侵袭,且能诱导细胞凋亡,促进体内CRC肿瘤生长和转移,可以作为CRC的预后生物标志物。
据报道,超过70个上调的circRNA参与CRC肿瘤发生和进展,通过siRNA/shRNA/ASO等干扰技术靶向干扰其表达水平,可以有效抑制肿瘤细胞增殖、迁移和凋亡,为改善CRC提供了一种新的治疗方法。作为肿瘤抑制因子的circRNA因其高稳定性和长半衰期,在CRC中具有显着的抗肿瘤作用,可以利用递送系统将体外合成的circRNA作为CRC细胞或组织中特定致癌miRNA的海绵,开发一种高效和创新的治疗方法。
/ 总结 /
circRNA凭借着高稳定性和组织表达特异性的特征,具有作为CRC诊断和预后的生物标志物以及CRC治疗靶点的潜在临床应用。然而,目前在CRC中只有少数circRNA的生物学功能和分子机制被挖掘,仍需要进一步研究阐明circRNA在CRC治疗中的作用,开发有效的circRNA递送系统到肿瘤细胞,以调节癌症进展;这需要成熟的circRNA体外制备技术和circRNA递送技术储备。
原文链接:
https://doi.org/10.1038/s41419-023-05881-2